25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0879 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0879  2'-5' RNA ligase  100 
 
 
173 aa  351  2.9999999999999997e-96  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.447955  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2328  2'-5' RNA ligase  34.32 
 
 
169 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.615122  hitchhiker  0.0000264925 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2919  2'-5' RNA ligase  34.91 
 
 
169 aa  108  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2941  hypothetical protein  34.13 
 
 
169 aa  103  9e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0204586  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2708  hypothetical protein  33.53 
 
 
169 aa  102  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0895027  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2951  2'-5' RNA ligase  34.13 
 
 
169 aa  101  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00126894  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2653  hypothetical protein  33.53 
 
 
169 aa  101  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000015631  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2904  2'-5' RNA ligase  33.53 
 
 
169 aa  101  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000106965 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2630  2'-5' RNA ligase  32.93 
 
 
169 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.987674  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0739  2'-5' RNA ligase  38.35 
 
 
134 aa  96.7  2e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00260297  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7068  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.25 
 
 
1007 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.332521  normal  0.746742 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1665  hypothetical protein  33.07 
 
 
173 aa  48.1  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4061  hypothetical protein  25 
 
 
172 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0537021  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1283  hypothetical protein  25 
 
 
172 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1135  hypothetical protein  24.39 
 
 
172 aa  44.7  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.899873  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1348  hypothetical protein  24.39 
 
 
172 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1241  hypothetical protein  23.78 
 
 
172 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.704202  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1309  hypothetical protein  23.78 
 
 
172 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000084419 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1148  hypothetical protein  23.78 
 
 
172 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1386  hypothetical protein  23.78 
 
 
172 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000316629  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0945  hypothetical protein  25.15 
 
 
172 aa  43.1  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1122  hypothetical protein  23.78 
 
 
172 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1129  hypothetical protein  23.78 
 
 
172 aa  43.5  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2526  hypothetical protein  21.18 
 
 
191 aa  41.2  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00348782  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0301  hypothetical protein  22.73 
 
 
184 aa  40.8  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.892707  normal  0.28683 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>