44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0544 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0544  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 		 344 aa  667    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0103771  normal  0.30561 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2847  hypothetical protein  30.58 
 
 		 299 aa  72  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367505  normal  0.0103117 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07085  hypothetical protein  24.4 
 
 		 340 aa  63.9  0.000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1402  AP endonuclease domain-containing protein  22.6 
 
 		 310 aa  60.5  0.00000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.326174 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1863  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.76 
 
 		 392 aa  60.1  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.97552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4758  hypothetical protein  27.91 
 
 		 358 aa  58.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.112624 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4191  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.96 
 
 		 304 aa  58.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0935651  normal  0.0459934 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0656  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.29 
 
 		 348 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0905047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1451  exodeoxyribonuclease III Xth  25.64 
 
 		 254 aa  53.5  0.000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.991336  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3661  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.67 
 
 		 356 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.680606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0260  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.48 
 
 		 639 aa  52.4  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.61014  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0858  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.04 
 
 		 371 aa  51.6  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1072  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.41 
 
 		 314 aa  50.1  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1092  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0859  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.39 
 
 		 367 aa  50.1  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2189  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.99 
 
 		 324 aa  50.1  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.18678 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0461  exodeoxyribonuclease III (xth)  28.94 
 
 		 267 aa  49.7  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.25576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2919  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28 
 
 		 312 aa  48.9  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000384293  hitchhiker  0.000191262 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2679  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.91 
 
 		 304 aa  48.9  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1051  metal-dependent hydrolase  27.67 
 
 		 369 aa  48.1  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2996  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.79 
 
 		 318 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3700  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.92 
 
 		 358 aa  47.8  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_118  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  27.17 
 
 		 639 aa  47.4  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0484  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.16 
 
 		 370 aa  47.4  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0347  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.13 
 
 		 343 aa  47.4  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1883  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.24 
 
 		 357 aa  46.2  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.95616  hitchhiker  0.0000000882358 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0337  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.45 
 
 		 323 aa  46.2  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129211  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3554  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.89 
 
 		 319 aa  46.2  0.0009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5198  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.47 
 
 		 278 aa  45.8  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.440175 
 
 
-
 
NC_002936  DET0108  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  25.87 
 
 		 591 aa  45.8  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0998  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.04 
 
 		 248 aa  45.8  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0392935  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0327  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.9 
 
 		 343 aa  44.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000168371 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2679  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.14 
 
 		 297 aa  45.1  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00635777  normal  0.660983 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4831  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.56 
 
 		 293 aa  45.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0147  metal-dependent hydrolase  27.14 
 
 		 673 aa  45.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1188  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.04 
 
 		 837 aa  44.3  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0035  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.38 
 
 		 365 aa  43.9  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.163228  normal  0.242955 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1227  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.06 
 
 		 371 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0187957  normal  0.460872 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7816  Metal-dependent hydrolase-like protein  29.17 
 
 		 313 aa  43.9  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1207  exodeoxyribonuclease III (xth)  29.24 
 
 		 256 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0113  AP endonuclease  26.39 
 
 		 267 aa  44.3  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3018  exodeoxyribonuclease III Xth  26.39 
 
 		 261 aa  43.5  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176682  normal  0.802869 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0900  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.14 
 
 		 354 aa  43.5  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0219654  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1921  metal-dependent hydrolase  25.2 
 
 		 320 aa  43.5  0.006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0209  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.56 
 
 		 283 aa  42.7  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>