23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3207 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3207  hypothetical protein  100 
 
 		 313 aa  632  1e-180  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.204724  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2996  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.38 
 
 		 318 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3245  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.71 
 
 		 318 aa  257  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3043  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.35 
 
 		 310 aa  248  9e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.524343 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2779  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.94 
 
 		 310 aa  247  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2657  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.65 
 
 		 337 aa  77.4  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0914  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.76 
 
 		 335 aa  69.3  0.00000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2189  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.66 
 
 		 324 aa  68.2  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.18678 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0260  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.16 
 
 		 340 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4122  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.45 
 
 		 326 aa  60.5  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0258  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.84 
 
 		 340 aa  59.7  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0621  AP endonuclease domain-containing protein  23.21 
 
 		 357 aa  59.7  0.00000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0622  AP endonuclease domain-containing protein  23.21 
 
 		 322 aa  57.8  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06361  hypothetical protein  25.43 
 
 		 308 aa  49.7  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4026  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.39 
 
 		 265 aa  48.9  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1015  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.55 
 
 		 301 aa  49.3  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.382783  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3537  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.12 
 
 		 351 aa  47  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal  0.737818 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01235  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  21.89 
 
 		 325 aa  46.6  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.201786  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0240  hypothetical protein  26.51 
 
 		 259 aa  46.2  0.0006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00126667  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4138  hypothetical protein  31.07 
 
 		 325 aa  46.2  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.21488  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2384  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.26 
 
 		 300 aa  44.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2500  hypothetical protein  26.27 
 
 		 334 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0903661  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3406  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 		 245 aa  43.5  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.325788  normal  0.617389 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>