19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06361 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06361  hypothetical protein  100 
 
 
308 aa  634    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001400  hypothetical protein  61 
 
 
304 aa  395  1e-109  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0346  putative nuclease  43.54 
 
 
319 aa  255  6e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0268024  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4122  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.17 
 
 
326 aa  70.5  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3087  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.57 
 
 
318 aa  62  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0757532  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1499  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.74 
 
 
312 aa  60.5  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.581311  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0260  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.42 
 
 
340 aa  56.6  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0258  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.08 
 
 
340 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1883  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.31 
 
 
357 aa  52  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.95616  hitchhiker  0.0000000882358 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0656  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.58 
 
 
348 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0905047  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3207  hypothetical protein  25.43 
 
 
313 aa  49.7  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.204724  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1262  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.19 
 
 
305 aa  49.3  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.338722  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3363  hypothetical protein  24.77 
 
 
321 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0719633 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2189  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.27 
 
 
324 aa  48.1  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.18678 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7816  Metal-dependent hydrolase-like protein  22.8 
 
 
313 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410751  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8349  hypothetical protein  24.7 
 
 
334 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.612911  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4164  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.19 
 
 
335 aa  47.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.427821  normal  0.414907 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4758  hypothetical protein  23.68 
 
 
358 aa  43.5  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.112624 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1868  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.69 
 
 
335 aa  43.5  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0536767  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>