50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7816 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7816  Metal-dependent hydrolase-like protein  100 
 
 		 313 aa  610  1e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2500  hypothetical protein  52.85 
 
 		 334 aa  277  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0903661  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1134  endonuclease/exonuclease/phosphatase  48.59 
 
 		 328 aa  233  3e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000366282 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1244  endonuclease/exonuclease/phosphatase  48.42 
 
 		 328 aa  228  1e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.54181 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8349  hypothetical protein  45.19 
 
 		 334 aa  213  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.612911  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2958  endonuclease/exonuclease/phosphatase  50.48 
 
 		 331 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0313395  normal  0.282504 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1262  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.53 
 
 		 305 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.338722  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0960  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.58 
 
 		 327 aa  174  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0337  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.49 
 
 		 323 aa  174  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129211  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3537  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.59 
 
 		 351 aa  154  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal  0.737818 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2399  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.65 
 
 		 341 aa  126  5e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0210  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.14 
 
 		 323 aa  124  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2919  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.25 
 
 		 312 aa  121  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000384293  hitchhiker  0.000191262 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1499  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.11 
 
 		 312 aa  121  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.581311  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3087  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.62 
 
 		 318 aa  118  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0757532  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0699  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.43 
 
 		 323 aa  117  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.803628  normal  0.0194962 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3086  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.25 
 
 		 314 aa  114  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0350421  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2153  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.59 
 
 		 351 aa  111  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000796237 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0945  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.32 
 
 		 330 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0928  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.32 
 
 		 330 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1072  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.21 
 
 		 314 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1092  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1678  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.47 
 
 		 331 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2674  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.03 
 
 		 344 aa  96.7  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.452558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1883  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.25 
 
 		 357 aa  95.5  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.95616  hitchhiker  0.0000000882358 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3661  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.34 
 
 		 356 aa  90.1  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.680606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1921  metal-dependent hydrolase  29.36 
 
 		 320 aa  89.4  7e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3933  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.14 
 
 		 318 aa  84.3  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1051  metal-dependent hydrolase  27.91 
 
 		 369 aa  69.7  0.00000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0656  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.73 
 
 		 348 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0905047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1227  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.07 
 
 		 371 aa  65.9  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0187957  normal  0.460872 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0327  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  23.89 
 
 		 391 aa  65.1  0.000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.552069 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3447  integral membrane protein  35.39 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256503  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26820  hypothetical protein  40.32 
 
 		 352 aa  55.1  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.873758 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0667  hypothetical protein  27.82 
 
 		 338 aa  55.8  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.906928  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0260  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.73 
 
 		 340 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0416  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.76 
 
 		 340 aa  55.1  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0988611  normal  0.136356 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001400  hypothetical protein  25.23 
 
 		 304 aa  53.5  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0258  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.36 
 
 		 340 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3554  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.1 
 
 		 319 aa  50.4  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4122  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.23 
 
 		 326 aa  50.1  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4164  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.11 
 
 		 335 aa  49.7  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.427821  normal  0.414907 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06361  hypothetical protein  22.8 
 
 		 308 aa  48.1  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0233  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.15 
 
 		 328 aa  47.4  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0209  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  21.5 
 
 		 283 aa  47  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0622  AP endonuclease domain-containing protein  24.24 
 
 		 322 aa  45.4  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0621  AP endonuclease domain-containing protein  24.54 
 
 		 357 aa  45.4  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3700  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.45 
 
 		 358 aa  44.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2384  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  20.97 
 
 		 300 aa  43.9  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0147  metal-dependent hydrolase  24.41 
 
 		 673 aa  43.5  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0783  hypothetical protein  35.38 
 
 		 177 aa  43.1  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>