20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001400 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_001400  hypothetical protein  100 
 
 
304 aa  620  1e-177  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06361  hypothetical protein  61 
 
 
308 aa  395  1e-109  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0346  putative nuclease  41.75 
 
 
319 aa  236  3e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0268024  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3087  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.37 
 
 
318 aa  71.6  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0757532  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4122  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.9 
 
 
326 aa  71.2  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1499  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.35 
 
 
312 aa  62.8  0.000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.581311  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4164  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.24 
 
 
335 aa  61.2  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.427821  normal  0.414907 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1883  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.22 
 
 
357 aa  54.3  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.95616  hitchhiker  0.0000000882358 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3363  hypothetical protein  23.66 
 
 
321 aa  53.5  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0719633 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7816  Metal-dependent hydrolase-like protein  25.23 
 
 
313 aa  53.5  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410751  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1227  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.46 
 
 
371 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0187957  normal  0.460872 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1868  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.48 
 
 
335 aa  51.2  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0536767  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1134  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.79 
 
 
328 aa  48.5  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000366282 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2958  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.11 
 
 
331 aa  48.1  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0313395  normal  0.282504 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1262  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.98 
 
 
305 aa  47  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.338722  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2189  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.86 
 
 
324 aa  45.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.18678 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0303  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.29 
 
 
249 aa  45.8  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401875  normal  0.151363 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0656  endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.77 
 
 
348 aa  43.1  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0905047  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4191  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.84 
 
 
304 aa  43.1  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0935651  normal  0.0459934 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1051  metal-dependent hydrolase  25.43 
 
 
369 aa  42.4  0.009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>