65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3363 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3363  hypothetical protein  100 
 
 		 321 aa  627  1e-179  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0719633 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2847  hypothetical protein  40.71 
 
 		 299 aa  198  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367505  normal  0.0103117 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4831  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.09 
 
 		 293 aa  154  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4191  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.55 
 
 		 304 aa  144  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0935651  normal  0.0459934 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4758  hypothetical protein  33.44 
 
 		 358 aa  142  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.112624 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1863  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.64 
 
 		 392 aa  129  8.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.97552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2626  hypothetical protein  33.64 
 
 		 347 aa  119  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3554  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.93 
 
 		 319 aa  77.4  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0656  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.37 
 
 		 348 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0905047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01235  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.84 
 
 		 325 aa  65.1  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.201786  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3087  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.91 
 
 		 318 aa  64.7  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0757532  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3661  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.31 
 
 		 356 aa  64.7  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.680606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1072  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.85 
 
 		 314 aa  62.8  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1092  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3086  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.94 
 
 		 314 aa  61.6  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0350421  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2958  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.33 
 
 		 331 aa  60.5  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0313395  normal  0.282504 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0960  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.3 
 
 		 327 aa  58.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0346  putative nuclease  25.28 
 
 		 319 aa  58.2  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0268024  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2987  YD repeat-containing protein  26.23 
 
 		 359 aa  57.8  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000379614 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1499  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.81 
 
 		 312 aa  57.4  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.581311  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0210  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.52 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5198  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.46 
 
 		 278 aa  56.2  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.440175 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001400  hypothetical protein  23.66 
 
 		 304 aa  55.8  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3933  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.36 
 
 		 318 aa  54.3  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1523  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.36 
 
 		 354 aa  53.9  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2107  hypothetical protein  26.61 
 
 		 367 aa  53.5  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0484  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  20.18 
 
 		 370 aa  53.1  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1262  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.5 
 
 		 305 aa  52  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.338722  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0337  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.74 
 
 		 323 aa  52.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129211  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06361  hypothetical protein  24.77 
 
 		 308 aa  51.6  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3786  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.1 
 
 		 269 aa  52  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0699  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.79 
 
 		 323 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.803628  normal  0.0194962 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4386  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.23 
 
 		 269 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1227  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.05 
 
 		 371 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0187957  normal  0.460872 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1522  hypothetical protein  23.87 
 
 		 372 aa  49.7  0.00007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.894535  normal  0.0489595 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3419  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  20.62 
 
 		 339 aa  49.7  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0928  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.89 
 
 		 330 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2919  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.99 
 
 		 312 aa  48.5  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000384293  hitchhiker  0.000191262 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0945  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.89 
 
 		 330 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0667  hypothetical protein  28.05 
 
 		 338 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.906928  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1700  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.78 
 
 		 373 aa  48.1  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.119105  normal  0.393122 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24830  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.95 
 
 		 276 aa  48.1  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.669671  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1678  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.97 
 
 		 331 aa  47  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1447  exodeoxyribonuclease III  33.68 
 
 		 258 aa  47  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.529853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2674  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.21 
 
 		 344 aa  47  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.452558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0035  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.77 
 
 		 365 aa  47.4  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.163228  normal  0.242955 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0416  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.7 
 
 		 340 aa  46.6  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0988611  normal  0.136356 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4164  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29 
 
 		 335 aa  46.6  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.427821  normal  0.414907 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1140  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.69 
 
 		 231 aa  46.6  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2783  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.23 
 
 		 313 aa  46.2  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0990816  normal  0.632411 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1883  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.92 
 
 		 357 aa  45.4  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.95616  hitchhiker  0.0000000882358 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8349  hypothetical protein  26.59 
 
 		 334 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.612911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0258  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.71 
 
 		 340 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1156  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.67 
 
 		 370 aa  45.1  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.876276  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3585  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.39 
 
 		 353 aa  45.1  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3875  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 		 353 aa  44.3  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2679  endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.78 
 
 		 304 aa  43.9  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2189  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.46 
 
 		 324 aa  44.3  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.18678 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4996  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  28 
 
 		 334 aa  43.9  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13807  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1380  endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.92 
 
 		 355 aa  43.9  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0260  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.71 
 
 		 340 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2384  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.6 
 
 		 300 aa  43.5  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21370  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.31 
 
 		 281 aa  43.1  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2356  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.09 
 
 		 259 aa  43.1  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.400478  normal  0.0671284 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0147  metal-dependent hydrolase  27.59 
 
 		 673 aa  42.7  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0469  hypothetical protein  27.11 
 
 		 248 aa  42.7  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.744864  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>