60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1921 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1921  metal-dependent hydrolase  100 
 
 
320 aa  657    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1883  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.85 
 
 
357 aa  206  4e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.95616  hitchhiker  0.0000000882358 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8349  hypothetical protein  32.87 
 
 
334 aa  144  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.612911  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3537  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.23 
 
 
351 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal  0.737818 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1262  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.32 
 
 
305 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.338722  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2919  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.64 
 
 
312 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000384293  hitchhiker  0.000191262 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2153  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.25 
 
 
351 aa  124  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000796237 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0210  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.46 
 
 
323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2399  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.96 
 
 
341 aa  116  6e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0960  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.53 
 
 
327 aa  116  6e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3086  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 
314 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0350421  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1134  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.85 
 
 
328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000366282 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1244  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.92 
 
 
328 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.54181 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1051  metal-dependent hydrolase  28.18 
 
 
369 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3933  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.15 
 
 
318 aa  110  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0337  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.29 
 
 
323 aa  110  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129211  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1499  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.04 
 
 
312 aa  109  6e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.581311  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1678  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.61 
 
 
331 aa  109  8.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0699  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.46 
 
 
323 aa  106  5e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.803628  normal  0.0194962 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2958  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.88 
 
 
331 aa  104  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0313395  normal  0.282504 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0945  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.1 
 
 
330 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0928  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.1 
 
 
330 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2500  hypothetical protein  31.93 
 
 
334 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0903661  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3087  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.28 
 
 
318 aa  98.6  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0757532  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7816  Metal-dependent hydrolase-like protein  28.57 
 
 
313 aa  98.2  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410751  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3661  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.64 
 
 
356 aa  95.9  9e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.680606  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1072  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.68 
 
 
314 aa  88.6  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1092  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2674  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.74 
 
 
344 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.452558  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0656  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.15 
 
 
348 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0905047  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0327  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  27.89 
 
 
391 aa  77.8  0.0000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.552069 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0416  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.22 
 
 
340 aa  73.9  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0988611  normal  0.136356 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0260  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.16 
 
 
340 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3554  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23 
 
 
319 aa  58.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2679  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.86 
 
 
304 aa  57.4  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0233  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.03 
 
 
328 aa  57.4  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10000  hypothetical protein  31.97 
 
 
365 aa  55.8  0.0000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.448913 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0258  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.84 
 
 
340 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3447  integral membrane protein  29.94 
 
 
200 aa  54.3  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256503  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4191  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.96 
 
 
304 aa  54.3  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0935651  normal  0.0459934 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26820  hypothetical protein  34.65 
 
 
352 aa  51.6  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.873758 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2847  hypothetical protein  25.25 
 
 
299 aa  50.8  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367505  normal  0.0103117 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4122  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.92 
 
 
326 aa  50.8  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2670  endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.18 
 
 
260 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246537  normal  0.0515035 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1227  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.1 
 
 
371 aa  50.4  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0187957  normal  0.460872 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2877  hypothetical protein  27.54 
 
 
277 aa  49.7  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1523  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.1 
 
 
354 aa  47.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4758  hypothetical protein  23.66 
 
 
358 aa  47  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.112624 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1868  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.08 
 
 
335 aa  47.4  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0536767  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4045  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.61 
 
 
242 aa  47.4  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24010  metal-dependent hydrolase  24.44 
 
 
286 aa  46.6  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.078651 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0452  hypothetical protein  24.37 
 
 
338 aa  44.7  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1700  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.47 
 
 
373 aa  44.7  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.119105  normal  0.393122 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4612  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.73 
 
 
268 aa  44.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0765415  normal  0.0123856 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4164  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.17 
 
 
335 aa  44.3  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.427821  normal  0.414907 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0783  hypothetical protein  32.35 
 
 
177 aa  44.3  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1522  hypothetical protein  25.58 
 
 
372 aa  44.3  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.894535  normal  0.0489595 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0544  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25 
 
 
344 aa  44.3  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0103771  normal  0.30561 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0667  hypothetical protein  22.62 
 
 
338 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.906928  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0260  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.33 
 
 
639 aa  43.9  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.61014  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1429  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.79 
 
 
204 aa  42.4  0.01  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>