55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_0945 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0928  endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 
330 aa  658    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0945  endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 
330 aa  658    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1678  endonuclease/exonuclease/phosphatase  54.29 
 
 
331 aa  304  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0699  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.92 
 
 
323 aa  207  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.803628  normal  0.0194962 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0210  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.78 
 
 
323 aa  204  1e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3086  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.3 
 
 
314 aa  147  3e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0350421  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1262  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.56 
 
 
305 aa  138  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.338722  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1499  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.35 
 
 
312 aa  125  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.581311  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3087  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.08 
 
 
318 aa  124  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0757532  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8349  hypothetical protein  33.76 
 
 
334 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.612911  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2500  hypothetical protein  33.74 
 
 
334 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0903661  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2919  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.55 
 
 
312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000384293  hitchhiker  0.000191262 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0337  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.96 
 
 
323 aa  112  7.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129211  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7816  Metal-dependent hydrolase-like protein  32.65 
 
 
313 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410751  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3933  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.54 
 
 
318 aa  109  7.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2674  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.63 
 
 
344 aa  105  7e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.452558  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0960  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.47 
 
 
327 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1134  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.08 
 
 
328 aa  103  4e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000366282 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1244  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 
328 aa  103  6e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.54181 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1883  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.19 
 
 
357 aa  99  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.95616  hitchhiker  0.0000000882358 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1921  metal-dependent hydrolase  30.9 
 
 
320 aa  97.8  2e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2958  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.09 
 
 
331 aa  94  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0313395  normal  0.282504 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3661  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.21 
 
 
356 aa  94  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.680606  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3537  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.77 
 
 
351 aa  90.5  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal  0.737818 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1051  metal-dependent hydrolase  31.74 
 
 
369 aa  90.5  4e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1072  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.98 
 
 
314 aa  89.7  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1092  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0327  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  25.14 
 
 
391 aa  86.3  6e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.552069 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2679  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.68 
 
 
304 aa  72.8  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2399  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.32 
 
 
341 aa  72  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2153  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.33 
 
 
351 aa  68.9  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000796237 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4191  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.08 
 
 
304 aa  67.4  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0935651  normal  0.0459934 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0656  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30 
 
 
348 aa  67.4  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0905047  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4758  hypothetical protein  27.01 
 
 
358 aa  66.2  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.112624 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3554  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.62 
 
 
319 aa  60.8  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2847  hypothetical protein  27.48 
 
 
299 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367505  normal  0.0103117 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3447  integral membrane protein  30.6 
 
 
200 aa  58.5  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256503  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0914  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.75 
 
 
335 aa  53.1  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1227  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.21 
 
 
371 aa  52.8  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0187957  normal  0.460872 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26820  hypothetical protein  30.33 
 
 
352 aa  52.4  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.873758 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4122  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25 
 
 
326 aa  51.6  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2626  hypothetical protein  27.47 
 
 
347 aa  49.7  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0667  hypothetical protein  28.34 
 
 
338 aa  49.3  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.906928  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0416  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.57 
 
 
340 aa  48.5  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0988611  normal  0.136356 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3363  hypothetical protein  26.78 
 
 
321 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0719633 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01235  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.25 
 
 
325 aa  48.5  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.201786  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0783  hypothetical protein  33.66 
 
 
177 aa  47  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1156  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.55 
 
 
370 aa  46.6  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.876276  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1402  AP endonuclease domain-containing protein  35.96 
 
 
310 aa  46.6  0.0006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.326174 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10000  hypothetical protein  32.06 
 
 
365 aa  46.2  0.0008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.448913 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4164  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 
335 aa  45.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.427821  normal  0.414907 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4831  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.76 
 
 
293 aa  45.4  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25550  metal-dependent hydrolase  34.83 
 
 
657 aa  44.7  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.202364 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0258  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.63 
 
 
340 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0260  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.63 
 
 
340 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2384  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.05 
 
 
300 aa  42.7  0.009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>