69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_25550 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_25550  metal-dependent hydrolase  100 
 
 
657 aa  1229    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.202364 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2849  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.42 
 
 
644 aa  158  3e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00190481  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0260  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.08 
 
 
639 aa  134  5e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.61014  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_118  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  34.33 
 
 
639 aa  131  5.0000000000000004e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6275  Metal-dependent hydrolase-like protein  31.44 
 
 
617 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0433121  decreased coverage  0.00812081 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0905  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.7 
 
 
278 aa  89.4  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965687  normal  0.246268 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5408  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.38 
 
 
634 aa  86.7  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.521256  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24010  metal-dependent hydrolase  30.3 
 
 
286 aa  82  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.078651 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3513  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.88 
 
 
236 aa  80.1  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00703913  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5423  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.23 
 
 
242 aa  79.7  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313531  hitchhiker  0.0062358 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0904  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.52 
 
 
289 aa  78.6  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  0.240953 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1188  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.76 
 
 
837 aa  73.9  0.000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5127  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.35 
 
 
242 aa  72.4  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.0539363 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0147  metal-dependent hydrolase  28.79 
 
 
673 aa  72.4  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4022  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.32 
 
 
271 aa  70.5  0.00000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4045  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.62 
 
 
242 aa  68.9  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5198  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.89 
 
 
278 aa  68.6  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.440175 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3786  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.2 
 
 
269 aa  68.2  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21370  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.67 
 
 
281 aa  67.8  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5005  hypothetical protein  30.43 
 
 
245 aa  65.9  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0791  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.36 
 
 
808 aa  64.7  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548418  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0383  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.31 
 
 
266 aa  61.6  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2528  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.82 
 
 
312 aa  61.6  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.772852  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2527  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.61 
 
 
576 aa  61.6  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0607  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.67 
 
 
253 aa  61.2  0.00000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2093  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.78 
 
 
284 aa  59.3  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1193  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.82 
 
 
244 aa  59.7  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0870  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.69 
 
 
287 aa  58.2  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.282627  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2799  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.79 
 
 
244 aa  57.8  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4845  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.23 
 
 
283 aa  55.5  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346949  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.39 
 
 
328 aa  55.5  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.215897  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4283  Metal-dependent exonuclease protein  28.02 
 
 
286 aa  55.1  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21864  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0201  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30 
 
 
264 aa  54.7  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0239  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.78 
 
 
258 aa  54.3  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.577245  normal  0.289646 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2670  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.16 
 
 
260 aa  54.3  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246537  normal  0.0515035 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0900  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.77 
 
 
257 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2329  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.07 
 
 
248 aa  53.5  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000636938  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4697  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.01 
 
 
328 aa  53.5  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4197  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.44 
 
 
288 aa  53.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4976  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.48 
 
 
266 aa  52.4  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000483065 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4386  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.84 
 
 
269 aa  51.6  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11000  metal-dependent hydrolase  28.57 
 
 
316 aa  52  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2555  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.27 
 
 
257 aa  50.1  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.337597  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3873  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.44 
 
 
288 aa  49.7  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0170416 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4612  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.23 
 
 
268 aa  49.3  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0765415  normal  0.0123856 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3480  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.81 
 
 
276 aa  49.7  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5119  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.36 
 
 
284 aa  49.3  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0533258  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1364  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.44 
 
 
301 aa  48.9  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.204083  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2759  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.74 
 
 
232 aa  48.5  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.429259  decreased coverage  0.00000225225 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1324  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.43 
 
 
285 aa  48.5  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0807274  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05011  integral plasma membrane protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09740)  24 
 
 
949 aa  47.8  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0782168  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2113  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.06 
 
 
284 aa  47.4  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0578211  normal  0.225636 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6090  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.69 
 
 
258 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18128  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1140  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.22 
 
 
231 aa  46.6  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3087  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28 
 
 
318 aa  46.6  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0757532  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1349  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.6 
 
 
287 aa  46.2  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.442404  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4026  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.49 
 
 
265 aa  46.6  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1059  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  27.8 
 
 
285 aa  45.4  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0432754  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1343  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.05 
 
 
279 aa  45.1  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591358  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2520  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.24 
 
 
232 aa  44.7  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1438  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.3 
 
 
291 aa  44.3  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.626738 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1350.1  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  34.09 
 
 
324 aa  44.7  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0665906  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2394  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.8 
 
 
240 aa  44.3  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0672115  normal  0.448912 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3724  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.28 
 
 
279 aa  44.3  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.236792  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0997  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  27.39 
 
 
285 aa  43.9  0.008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3007  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.28 
 
 
279 aa  44.3  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72430  hypothetical protein  26.47 
 
 
292 aa  43.9  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0945  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.83 
 
 
330 aa  43.9  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0928  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.83 
 
 
330 aa  43.9  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>