32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2847 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2847  hypothetical protein  100 
 
 		 299 aa  586  1e-166  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367505  normal  0.0103117 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4831  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.06 
 
 		 293 aa  203  3e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3363  hypothetical protein  39.35 
 
 		 321 aa  189  5e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0719633 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4191  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.36 
 
 		 304 aa  186  5e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0935651  normal  0.0459934 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4758  hypothetical protein  38.38 
 
 		 358 aa  168  9e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.112624 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2626  hypothetical protein  40.41 
 
 		 347 aa  158  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1863  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.02 
 
 		 392 aa  130  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.97552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0699  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.15 
 
 		 323 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.803628  normal  0.0194962 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2679  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.26 
 
 		 304 aa  73.9  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0210  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.52 
 
 		 323 aa  72.8  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3554  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.65 
 
 		 319 aa  68.6  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0656  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.06 
 
 		 348 aa  63.5  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0905047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3086  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.93 
 
 		 314 aa  62  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0350421  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3087  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.28 
 
 		 318 aa  58.5  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0757532  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0945  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.05 
 
 		 330 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0928  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.05 
 
 		 330 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0544  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.72 
 
 		 344 aa  57.4  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0103771  normal  0.30561 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2919  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.33 
 
 		 312 aa  55.8  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000384293  hitchhiker  0.000191262 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1499  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.48 
 
 		 312 aa  54.7  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.581311  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1883  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.39 
 
 		 357 aa  53.5  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.95616  hitchhiker  0.0000000882358 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3933  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.17 
 
 		 318 aa  52.4  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1227  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.48 
 
 		 371 aa  50.4  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0187957  normal  0.460872 
 
 
-
 
NC_002950  PG1402  AP endonuclease domain-containing protein  36.84 
 
 		 310 aa  47.8  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.326174 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1678  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.73 
 
 		 331 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1921  metal-dependent hydrolase  27.35 
 
 		 320 aa  46.6  0.0005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1262  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.12 
 
 		 305 aa  46.2  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.338722  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1868  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.54 
 
 		 335 aa  45.4  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0536767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2500  hypothetical protein  27.1 
 
 		 334 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0903661  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1156  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.27 
 
 		 370 aa  43.9  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.876276  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2958  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.64 
 
 		 331 aa  43.9  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0313395  normal  0.282504 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6062  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.15 
 
 		 236 aa  43.5  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.640142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0808  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.26 
 
 		 257 aa  42.7  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.555445  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>