37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0667 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0667  hypothetical protein  100 
 
 		 338 aa  676    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.906928  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0347  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.62 
 
 		 343 aa  100  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0327  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.44 
 
 		 343 aa  95.1  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000168371 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0900  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.85 
 
 		 354 aa  85.9  9e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0219654  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0858  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  21.68 
 
 		 371 aa  75.5  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3875  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.68 
 
 		 387 aa  73.9  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.295355  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3700  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.51 
 
 		 358 aa  71.6  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4996  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  26.27 
 
 		 334 aa  71.2  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13807  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1072  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.66 
 
 		 314 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1092  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3661  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.27 
 
 		 356 aa  67  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.680606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1262  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.97 
 
 		 305 aa  67  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.338722  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1499  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.2 
 
 		 312 aa  61.2  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.581311  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2674  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.82 
 
 		 344 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.452558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0960  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25 
 
 		 327 aa  56.6  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07085  hypothetical protein  23.42 
 
 		 340 aa  56.2  0.0000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0208  endonuclease/exonuclease/phosphatase  21.78 
 
 		 305 aa  55.8  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7816  Metal-dependent hydrolase-like protein  27.82 
 
 		 313 aa  55.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0656  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.17 
 
 		 348 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0905047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1244  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.38 
 
 		 328 aa  52  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.54181 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1227  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.32 
 
 		 371 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0187957  normal  0.460872 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3087  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.71 
 
 		 318 aa  51.2  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0757532  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3933  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.3 
 
 		 318 aa  51.6  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3554  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.22 
 
 		 319 aa  49.7  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1778  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.85 
 
 		 362 aa  49.7  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.182404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0928  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.63 
 
 		 330 aa  49.3  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0945  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.63 
 
 		 330 aa  49.3  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0484  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  21.58 
 
 		 370 aa  48.1  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1134  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.34 
 
 		 328 aa  48.5  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000366282 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0035  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.05 
 
 		 365 aa  45.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.163228  normal  0.242955 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4758  hypothetical protein  24.4 
 
 		 358 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.112624 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1678  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.35 
 
 		 331 aa  44.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1140  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.82 
 
 		 231 aa  44.7  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1921  metal-dependent hydrolase  23.02 
 
 		 320 aa  43.5  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4026  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.65 
 
 		 265 aa  43.1  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6162  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.35 
 
 		 252 aa  43.1  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0634319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2189  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.92 
 
 		 324 aa  42.7  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.18678 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4845  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.52 
 
 		 283 aa  42.4  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346949  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>