52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1244 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1244  endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 		 328 aa  632  1e-180  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.54181 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1134  endonuclease/exonuclease/phosphatase  84.76 
 
 		 328 aa  514  1.0000000000000001e-145  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000366282 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7816  Metal-dependent hydrolase-like protein  48.42 
 
 		 313 aa  245  8e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1262  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.04 
 
 		 305 aa  237  2e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.338722  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8349  hypothetical protein  48.73 
 
 		 334 aa  230  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.612911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2500  hypothetical protein  43.3 
 
 		 334 aa  212  7.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0903661  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2958  endonuclease/exonuclease/phosphatase  48.29 
 
 		 331 aa  202  5e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0313395  normal  0.282504 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0337  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.31 
 
 		 323 aa  196  4.0000000000000005e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129211  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0960  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.74 
 
 		 327 aa  187  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3537  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.32 
 
 		 351 aa  169  4e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal  0.737818 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0210  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.18 
 
 		 323 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1499  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.73 
 
 		 312 aa  133  3.9999999999999996e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.581311  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2399  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.2 
 
 		 341 aa  130  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0699  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.01 
 
 		 323 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.803628  normal  0.0194962 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3087  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.27 
 
 		 318 aa  127  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0757532  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2919  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.33 
 
 		 312 aa  123  5e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000384293  hitchhiker  0.000191262 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2153  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.57 
 
 		 351 aa  121  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000796237 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3086  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.15 
 
 		 314 aa  114  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0350421  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1921  metal-dependent hydrolase  33.92 
 
 		 320 aa  113  5e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1072  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.6 
 
 		 314 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1092  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0945  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.93 
 
 		 330 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0928  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.93 
 
 		 330 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3933  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.33 
 
 		 318 aa  101  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2674  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.59 
 
 		 344 aa  100  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.452558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3661  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.63 
 
 		 356 aa  99.4  7e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.680606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1678  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.89 
 
 		 331 aa  96.3  7e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1883  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.6 
 
 		 357 aa  94.7  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.95616  hitchhiker  0.0000000882358 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26820  hypothetical protein  30.8 
 
 		 352 aa  76.3  0.0000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.873758 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1051  metal-dependent hydrolase  27.31 
 
 		 369 aa  73.6  0.000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3447  integral membrane protein  37.5 
 
 		 200 aa  72.4  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256503  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0656  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.52 
 
 		 348 aa  67  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0905047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3554  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.01 
 
 		 319 aa  64.3  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0327  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  22.87 
 
 		 391 aa  63.5  0.000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.552069 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0416  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.27 
 
 		 340 aa  58.5  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0988611  normal  0.136356 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0667  hypothetical protein  27.38 
 
 		 338 aa  52.8  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.906928  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1106  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.21 
 
 		 358 aa  52.8  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332998  normal  0.673739 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0233  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.44 
 
 		 328 aa  52.4  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001400  hypothetical protein  22.71 
 
 		 304 aa  51.2  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1227  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.74 
 
 		 371 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0187957  normal  0.460872 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2679  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.26 
 
 		 304 aa  50.8  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3700  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.17 
 
 		 358 aa  50.1  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0452  hypothetical protein  30.48 
 
 		 338 aa  48.1  0.0002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0914  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.09 
 
 		 335 aa  48.1  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4164  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.36 
 
 		 335 aa  47.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.427821  normal  0.414907 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10000  hypothetical protein  36.79 
 
 		 365 aa  46.6  0.0006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.448913 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0260  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.91 
 
 		 340 aa  46.6  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3363  hypothetical protein  28.7 
 
 		 321 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0719633 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0783  hypothetical protein  40.86 
 
 		 177 aa  45.8  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4122  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.6 
 
 		 326 aa  45.8  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1156  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.04 
 
 		 370 aa  44.3  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.876276  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0258  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.51 
 
 		 340 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3057  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.05 
 
 		 359 aa  43.5  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>