34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0416 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0416  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 		 340 aa  635    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0988611  normal  0.136356 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0233  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.78 
 
 		 328 aa  134  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26820  hypothetical protein  38.99 
 
 		 352 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.873758 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0960  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.89 
 
 		 327 aa  83.2  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3086  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.15 
 
 		 314 aa  79  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0350421  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2919  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.04 
 
 		 312 aa  75.9  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000384293  hitchhiker  0.000191262 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1921  metal-dependent hydrolase  30.36 
 
 		 320 aa  75.5  0.000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1262  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34 
 
 		 305 aa  69.3  0.00000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.338722  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0452  hypothetical protein  20.15 
 
 		 338 aa  68.2  0.0000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8349  hypothetical protein  29.82 
 
 		 334 aa  66.2  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.612911  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1499  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.6 
 
 		 312 aa  65.9  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.581311  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1134  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.13 
 
 		 328 aa  62.8  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000366282 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3087  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.65 
 
 		 318 aa  61.2  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0757532  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2500  hypothetical protein  32.59 
 
 		 334 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0903661  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7816  Metal-dependent hydrolase-like protein  33.45 
 
 		 313 aa  60.5  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410751  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2958  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.04 
 
 		 331 aa  60.5  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0313395  normal  0.282504 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1244  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.27 
 
 		 328 aa  58.9  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.54181 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1883  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.07 
 
 		 357 aa  58.5  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.95616  hitchhiker  0.0000000882358 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2399  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.41 
 
 		 341 aa  55.5  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0337  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.98 
 
 		 323 aa  55.5  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129211  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3933  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.63 
 
 		 318 aa  54.7  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2153  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.71 
 
 		 351 aa  53.9  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000796237 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10000  hypothetical protein  28.86 
 
 		 365 aa  51.6  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.448913 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3537  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.87 
 
 		 351 aa  51.2  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal  0.737818 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0928  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.69 
 
 		 330 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0945  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.69 
 
 		 330 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1051  metal-dependent hydrolase  24.79 
 
 		 369 aa  50.1  0.00006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1678  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.63 
 
 		 331 aa  49.7  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3363  hypothetical protein  40.7 
 
 		 321 aa  46.6  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0719633 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3447  integral membrane protein  33.54 
 
 		 200 aa  46.6  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256503  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0210  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.84 
 
 		 323 aa  44.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0699  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.71 
 
 		 323 aa  44.7  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.803628  normal  0.0194962 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1072  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.57 
 
 		 314 aa  43.5  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1092  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2996  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.17 
 
 		 318 aa  43.1  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>