54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3537 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3537  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 		 351 aa  661    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal  0.737818 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1262  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.39 
 
 		 305 aa  179  4e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.338722  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1134  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.99 
 
 		 328 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000366282 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8349  hypothetical protein  41.61 
 
 		 334 aa  171  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.612911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2500  hypothetical protein  37.27 
 
 		 334 aa  171  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0903661  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0337  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.65 
 
 		 323 aa  171  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129211  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7816  Metal-dependent hydrolase-like protein  38.46 
 
 		 313 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1244  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.24 
 
 		 328 aa  167  4e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.54181 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2958  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.67 
 
 		 331 aa  157  3e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0313395  normal  0.282504 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0960  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.73 
 
 		 327 aa  155  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2399  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40 
 
 		 341 aa  148  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2153  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.41 
 
 		 351 aa  146  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000796237 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1921  metal-dependent hydrolase  38.1 
 
 		 320 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2919  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.99 
 
 		 312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000384293  hitchhiker  0.000191262 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1883  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.8 
 
 		 357 aa  109  6e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.95616  hitchhiker  0.0000000882358 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1072  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.91 
 
 		 314 aa  105  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1092  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3661  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.9 
 
 		 356 aa  100  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.680606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1051  metal-dependent hydrolase  28.98 
 
 		 369 aa  96.7  5e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3086  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.99 
 
 		 314 aa  92.8  9e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0350421  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0210  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.48 
 
 		 323 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3087  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.85 
 
 		 318 aa  91.7  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0757532  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1678  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.49 
 
 		 331 aa  89.7  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1499  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.76 
 
 		 312 aa  89.4  8e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.581311  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0945  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.51 
 
 		 330 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0928  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.51 
 
 		 330 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0327  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  26.05 
 
 		 391 aa  87.4  4e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.552069 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0699  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.14 
 
 		 323 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.803628  normal  0.0194962 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3933  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.53 
 
 		 318 aa  82.4  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0656  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.67 
 
 		 348 aa  80.1  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0905047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2674  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.24 
 
 		 344 aa  76.6  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.452558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26820  hypothetical protein  43.24 
 
 		 352 aa  62.4  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.873758 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1227  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.96 
 
 		 371 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0187957  normal  0.460872 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4164  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.83 
 
 		 335 aa  57  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.427821  normal  0.414907 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3447  integral membrane protein  33.91 
 
 		 200 aa  55.5  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256503  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0621  AP endonuclease domain-containing protein  26.16 
 
 		 357 aa  54.3  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0622  AP endonuclease domain-containing protein  26.16 
 
 		 322 aa  53.5  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10000  hypothetical protein  37.6 
 
 		 365 aa  53.1  0.000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.448913 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0416  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30 
 
 		 340 aa  52.8  0.000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0988611  normal  0.136356 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0914  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.98 
 
 		 335 aa  52.4  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2657  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.13 
 
 		 337 aa  50.1  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0233  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.22 
 
 		 328 aa  50.1  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3554  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.69 
 
 		 319 aa  47.8  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0452  hypothetical protein  26.98 
 
 		 338 aa  47.8  0.0003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4122  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.27 
 
 		 326 aa  47  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3363  hypothetical protein  27.89 
 
 		 321 aa  46.6  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0719633 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3207  hypothetical protein  28.12 
 
 		 313 aa  46.2  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.204724  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01980  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  36.96 
 
 		 286 aa  46.2  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.496471  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0783  hypothetical protein  33.62 
 
 		 177 aa  45.4  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2189  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.91 
 
 		 324 aa  43.9  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.18678 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2384  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.11 
 
 		 300 aa  43.9  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0209  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.91 
 
 		 283 aa  43.5  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0093  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.29 
 
 		 294 aa  43.5  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4996  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  23.94 
 
 		 334 aa  43.5  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13807  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2601  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  32.53 
 
 		 282 aa  43.1  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.792599  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>