92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2601 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2601  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  100 
 
 		 282 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.792599  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2849  endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.1 
 
 		 276 aa  256  2e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.942011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2639  endonuclease/exonuclease/phosphatase  49.79 
 
 		 288 aa  247  2e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2393  endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.27 
 
 		 277 aa  247  2e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5100  endonuclease/exonuclease/phosphatase  50.6 
 
 		 284 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0779207 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6287  hypothetical protein  50.4 
 
 		 274 aa  240  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3567  endonuclease/exonuclease/phosphatase  49.8 
 
 		 286 aa  238  9e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.202667  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72430  hypothetical protein  50 
 
 		 292 aa  237  1e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0267  endonuclease/exonuclease/phosphatase  49.6 
 
 		 291 aa  237  2e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0340  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  48.8 
 
 		 291 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0143  endonuclease/exonuclease/phosphatase  48.61 
 
 		 284 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0051  endonuclease/exonuclease/phosphatase  49 
 
 		 292 aa  231  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.171004 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01980  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  48.02 
 
 		 286 aa  230  2e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.496471  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0145  endonuclease/exonuclease/phosphatase  48.21 
 
 		 284 aa  228  7e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.883526  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0128  endonuclease/exonuclease/phosphatase  48.21 
 
 		 284 aa  228  7e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.503703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0694  endonuclease/exonuclease/phosphatase  45.6 
 
 		 256 aa  226  4e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.4725  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0159  endonuclease/exonuclease/phosphatase  46.4 
 
 		 290 aa  225  8e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.171713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04435  endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.37 
 
 		 255 aa  223  3e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3119  endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.76 
 
 		 271 aa  221  9e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.635423  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0781  hypothetical protein  45.2 
 
 		 256 aa  220  1.9999999999999999e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0093  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.86 
 
 		 294 aa  217  1e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3406  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  46.84 
 
 		 245 aa  218  1e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.325788  normal  0.617389 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0035  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.43 
 
 		 290 aa  201  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.742577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2166  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.46 
 
 		 286 aa  198  7e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0649  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  41.87 
 
 		 250 aa  179  4e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.441021  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0800  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.53 
 
 		 258 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.179814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2799  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.32 
 
 		 244 aa  75.5  0.0000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1193  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.73 
 
 		 244 aa  74.3  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3513  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.34 
 
 		 236 aa  71.6  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00703913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5005  hypothetical protein  30.68 
 
 		 245 aa  70.5  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0607  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.72 
 
 		 253 aa  70.5  0.00000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0900  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.04 
 
 		 257 aa  69.7  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4022  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.69 
 
 		 271 aa  68.9  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0791  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.03 
 
 		 808 aa  68.6  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21370  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.95 
 
 		 281 aa  68.6  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2329  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.63 
 
 		 248 aa  65.1  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000636938  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1188  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.8 
 
 		 837 aa  63.9  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1343  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.87 
 
 		 279 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591358  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0905  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.5 
 
 		 278 aa  61.2  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965687  normal  0.246268 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2555  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.76 
 
 		 257 aa  60.5  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.337597  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1514  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.07 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.126297 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2727  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.52 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.216689  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0692  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.4 
 
 		 245 aa  58.9  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.221154  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4845  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.84 
 
 		 283 aa  58.9  0.00000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.31 
 
 		 328 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.215897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4697  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.45 
 
 		 328 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1034  hypothetical protein  31.75 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4026  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.11 
 
 		 265 aa  52.4  0.000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3253  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.59 
 
 		 253 aa  52  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.378001  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0201  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29 
 
 		 264 aa  52  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2216  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.65 
 
 		 243 aa  51.2  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0194229  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6275  Metal-dependent hydrolase-like protein  31.63 
 
 		 617 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0433121  decreased coverage  0.00812081 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0904  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.34 
 
 		 289 aa  50.8  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  0.240953 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2832  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.37 
 
 		 260 aa  49.7  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.313269  decreased coverage  0.00271528 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6773  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.57 
 
 		 271 aa  49.7  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.67063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1324  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.22 
 
 		 285 aa  49.7  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0807274  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0108  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  23.44 
 
 		 591 aa  48.9  0.00008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24010  metal-dependent hydrolase  26.81 
 
 		 286 aa  48.9  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.078651 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2865  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.82 
 
 		 261 aa  48.9  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2679  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.71 
 
 		 282 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0980  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.06 
 
 		 249 aa  48.9  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0478352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2772  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.82 
 
 		 261 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.472556  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_118  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  27.4 
 
 		 639 aa  48.1  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2849  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.69 
 
 		 644 aa  47.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00190481  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0962  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.83 
 
 		 255 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0080  hypothetical protein  27.82 
 
 		 302 aa  48.1  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0239  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.63 
 
 		 258 aa  47.4  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.577245  normal  0.289646 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0980  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.83 
 
 		 255 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal  0.0626393 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0003  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  24.54 
 
 		 299 aa  48.1  0.0002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0990  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.83 
 
 		 255 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5127  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.64 
 
 		 242 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.0539363 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5423  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.97 
 
 		 242 aa  47.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313531  hitchhiker  0.0062358 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1010  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.44 
 
 		 261 aa  47.4  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4976  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.43 
 
 		 266 aa  47  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000483065 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5868  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.42 
 
 		 271 aa  46.6  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.432007  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1059  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  25.5 
 
 		 285 aa  46.6  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0432754  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4045  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.47 
 
 		 242 aa  47  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0260  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.26 
 
 		 639 aa  46.6  0.0005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.61014  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3504  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  30.41 
 
 		 237 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.40759  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0997  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  25.17 
 
 		 285 aa  45.8  0.0008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1051  metal-dependent hydrolase  32.53 
 
 		 369 aa  44.7  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3480  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.36 
 
 		 276 aa  44.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5307  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.77 
 
 		 244 aa  43.9  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3786  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.34 
 
 		 269 aa  43.9  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3653  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.21 
 
 		 249 aa  44.3  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.477132  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2702  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.31 
 
 		 265 aa  43.5  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3760  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.21 
 
 		 249 aa  43.5  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0086  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.92 
 
 		 257 aa  43.5  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3505  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.3 
 
 		 236 aa  43.1  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443664 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25550  metal-dependent hydrolase  27.19 
 
 		 657 aa  43.1  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.202364 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0330  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.26 
 
 		 262 aa  42.4  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0263555  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2205  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.48 
 
 		 260 aa  42.4  0.01  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.586211  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>