65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0330 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0330  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 		 262 aa  494  1e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0263555  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3798  endonuclease/exonuclease/phosphatase  49.06 
 
 		 263 aa  180  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00159012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1174  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.17 
 
 		 257 aa  166  2.9999999999999998e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.834262  normal  0.168848 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2832  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.55 
 
 		 260 aa  158  9e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.313269  decreased coverage  0.00271528 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0808  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.8 
 
 		 257 aa  149  4e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.555445  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0929  endonuclease/exonuclease/phosphatase  46.79 
 
 		 259 aa  140  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.391996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4386  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.85 
 
 		 269 aa  138  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0962  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.39 
 
 		 255 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0990  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.39 
 
 		 255 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0980  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.39 
 
 		 255 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal  0.0626393 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2507  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.66 
 
 		 260 aa  119  6e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.366976  normal  0.0314465 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2356  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.22 
 
 		 259 aa  118  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.400478  normal  0.0671284 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0040  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.95 
 
 		 329 aa  103  4e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3480  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.13 
 
 		 276 aa  97.8  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5198  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.62 
 
 		 278 aa  55.8  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.440175 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0209  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.17 
 
 		 283 aa  55.5  0.0000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3358  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.51 
 
 		 298 aa  54.3  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2329  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.58 
 
 		 248 aa  53.5  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000636938  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0791  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.12 
 
 		 808 aa  52.8  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0800  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.34 
 
 		 258 aa  50.8  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.179814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5450  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.88 
 
 		 257 aa  51.2  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0649  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  28.34 
 
 		 250 aa  50.4  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.441021  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4697  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.97 
 
 		 328 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5005  hypothetical protein  26.04 
 
 		 245 aa  50.1  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4976  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.19 
 
 		 266 aa  49.7  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000483065 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5127  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.77 
 
 		 242 aa  49.3  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.0539363 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4045  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.14 
 
 		 242 aa  49.3  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0905  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.27 
 
 		 278 aa  49.3  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965687  normal  0.246268 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24010  metal-dependent hydrolase  26.55 
 
 		 286 aa  49.3  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.078651 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0900  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.47 
 
 		 257 aa  49.3  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3731  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.71 
 
 		 243 aa  48.9  0.00009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3567  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.44 
 
 		 286 aa  48.1  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.202667  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.57 
 
 		 328 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.215897  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2601  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  27.5 
 
 		 282 aa  48.1  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.792599  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6275  Metal-dependent hydrolase-like protein  36.67 
 
 		 617 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0433121  decreased coverage  0.00812081 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5732  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.7 
 
 		 300 aa  47  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.673881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1327  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.56 
 
 		 245 aa  47  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.51669  hitchhiker  0.00270426 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1188  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.4 
 
 		 837 aa  46.6  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.14 
 
 		 263 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42531  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6501  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.14 
 
 		 263 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.126817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0606  endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.22 
 
 		 250 aa  46.2  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.374942  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5423  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.17 
 
 		 242 aa  45.8  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313531  hitchhiker  0.0062358 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1299  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.76 
 
 		 252 aa  45.8  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6090  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.03 
 
 		 258 aa  45.8  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3633  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.67 
 
 		 252 aa  45.4  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0240015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11000  metal-dependent hydrolase  33.01 
 
 		 316 aa  44.7  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5408  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.8 
 
 		 634 aa  44.7  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.521256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1524  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.7 
 
 		 228 aa  45.4  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0806  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.98 
 
 		 255 aa  44.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.636912  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0607  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.73 
 
 		 253 aa  44.7  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2384  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.68 
 
 		 300 aa  44.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2799  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.97 
 
 		 244 aa  44.3  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0877  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.98 
 
 		 255 aa  44.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4298  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.41 
 
 		 259 aa  44.3  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5588  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.41 
 
 		 269 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4845  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.24 
 
 		 283 aa  43.9  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0383  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.9 
 
 		 266 aa  43.5  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0904  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.63 
 
 		 289 aa  43.1  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  0.240953 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6314  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.96 
 
 		 269 aa  42.7  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0901897 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1880  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  29.67 
 
 		 338 aa  42.7  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.850381  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1972  metal-dependent hydrolase  29.67 
 
 		 338 aa  42.7  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2380  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.02 
 
 		 251 aa  42.7  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.835809 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2727  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.39 
 
 		 246 aa  42.7  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.216689  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5493  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.92 
 
 		 278 aa  42.4  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306278  hitchhiker  0.00234729 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0408  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  32.23 
 
 		 1153 aa  42  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.352854  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>