229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A1972 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A0408  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  98.52 
 
 
1153 aa  659    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.352854  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1972  metal-dependent hydrolase  100 
 
 
338 aa  659    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1880  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  98.52 
 
 
338 aa  649    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.850381  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  80.51 
 
 
263 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42531  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6501  endonuclease/exonuclease/phosphatase  80.51 
 
 
263 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.126817  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6090  endonuclease/exonuclease/phosphatase  78.93 
 
 
258 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18128  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6314  endonuclease/exonuclease/phosphatase  79.24 
 
 
269 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0901897 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5588  endonuclease/exonuclease/phosphatase  79.24 
 
 
269 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15644  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5493  endonuclease/exonuclease/phosphatase  82.3 
 
 
278 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306278  hitchhiker  0.00234729 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5411  endonuclease/exonuclease/phosphatase  64.91 
 
 
250 aa  273  3e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.746518 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3204  endonuclease/exonuclease/phosphatase  51.28 
 
 
259 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1524  endonuclease/exonuclease/phosphatase  46.67 
 
 
228 aa  189  7e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1473  hypothetical protein  49.13 
 
 
273 aa  177  3e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.257293  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0239  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.43 
 
 
258 aa  171  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.577245  normal  0.289646 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2132  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.89 
 
 
226 aa  149  6e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2520  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.97 
 
 
232 aa  144  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1140  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.09 
 
 
231 aa  142  9e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3930  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.79 
 
 
247 aa  134  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0720293 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2670  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.38 
 
 
260 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246537  normal  0.0515035 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0201  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.25 
 
 
264 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4026  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.68 
 
 
265 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2679  endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.07 
 
 
282 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2865  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.22 
 
 
261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2772  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.22 
 
 
261 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.472556  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1422  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.59 
 
 
235 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.329688 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2394  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.72 
 
 
240 aa  119  7e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0672115  normal  0.448912 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3731  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.4 
 
 
243 aa  117  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0496  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.96 
 
 
246 aa  114  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0472  hypothetical protein  36.12 
 
 
240 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2124  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.12 
 
 
240 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.908976 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4845  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.77 
 
 
283 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346949  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2363  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.44 
 
 
255 aa  108  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6773  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.94 
 
 
271 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.67063  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4045  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.29 
 
 
242 aa  107  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4697  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.34 
 
 
328 aa  107  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1916  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.71 
 
 
230 aa  107  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1059  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  35.78 
 
 
285 aa  106  5e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0432754  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1188  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.47 
 
 
837 aa  106  6e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1324  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.15 
 
 
285 aa  105  9e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0807274  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.34 
 
 
328 aa  105  9e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.215897  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0997  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  35.96 
 
 
285 aa  105  9e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01462  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.86 
 
 
233 aa  105  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0870  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.6 
 
 
287 aa  104  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.282627  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0003  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  31.78 
 
 
299 aa  104  3e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0791  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.97 
 
 
808 aa  102  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548418  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5868  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.55 
 
 
271 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.432007  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0383  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.57 
 
 
266 aa  99.8  5e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2325  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.34 
 
 
231 aa  99.8  6e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.415298 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3253  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 
253 aa  98.6  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.378001  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0846  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.96 
 
 
292 aa  99  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2380  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.85 
 
 
251 aa  97.8  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.835809 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5127  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.98 
 
 
242 aa  97.4  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.0539363 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5423  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.69 
 
 
242 aa  96.3  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313531  hitchhiker  0.0062358 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0692  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.3 
 
 
245 aa  96.3  6e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.221154  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0900  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.45 
 
 
257 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5307  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.16 
 
 
244 aa  94.4  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2216  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.35 
 
 
243 aa  94.4  3e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0194229  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2799  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.48 
 
 
244 aa  94.4  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3760  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34 
 
 
249 aa  93.6  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1343  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.5 
 
 
279 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591358  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3653  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.6 
 
 
249 aa  92.4  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.477132  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1072  hypothetical protein  33.86 
 
 
270 aa  90.1  5e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.348031  normal  0.384131 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5005  hypothetical protein  31.45 
 
 
245 aa  88.6  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0008  hypothetical protein  34.76 
 
 
244 aa  86.7  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000326697  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4016  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.98 
 
 
276 aa  86.3  8e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000734924 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1327  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.12 
 
 
245 aa  85.9  9e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.51669  hitchhiker  0.00270426 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0806  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.88 
 
 
255 aa  84.7  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.636912  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0877  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.88 
 
 
255 aa  84.7  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21370  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.04 
 
 
281 aa  84.3  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5450  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.8 
 
 
257 aa  83.6  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1514  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.39 
 
 
246 aa  84  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.126297 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3633  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.15 
 
 
252 aa  82.8  0.000000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0240015  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3265  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.6 
 
 
257 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.585826  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0420  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.75 
 
 
236 aa  82.8  0.000000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3513  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.09 
 
 
236 aa  82.8  0.000000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00703913  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0344  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.14 
 
 
248 aa  82.8  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0359  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.14 
 
 
248 aa  82.8  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0469  hypothetical protein  33.73 
 
 
248 aa  80.9  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.744864  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2495  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.2 
 
 
257 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0534  hypothetical protein  26.85 
 
 
257 aa  80.5  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0510  hypothetical protein  26.85 
 
 
257 aa  80.1  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0209  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.57 
 
 
283 aa  80.1  0.00000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2727  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.26 
 
 
246 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.216689  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2877  hypothetical protein  34.93 
 
 
277 aa  79.3  0.00000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3786  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.48 
 
 
269 aa  79.3  0.00000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1281  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.2 
 
 
253 aa  79.3  0.00000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2631  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.4 
 
 
257 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.363839 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2515  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.88 
 
 
256 aa  79  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.764021  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0442  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.98 
 
 
262 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4022  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.2 
 
 
271 aa  77.8  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2424  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.88 
 
 
253 aa  77.4  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.123297  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0940  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  31.54 
 
 
252 aa  77  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00426171  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0961  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  31.54 
 
 
252 aa  77  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0876  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  31.54 
 
 
252 aa  77  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0606  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.56 
 
 
250 aa  77  0.0000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.374942  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0848  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  31.54 
 
 
252 aa  77  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0908  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  31.54 
 
 
252 aa  77  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0916506  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4120  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.92 
 
 
250 aa  77  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2284  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.58 
 
 
262 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0656369  hitchhiker  0.000754964 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0854  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  30.83 
 
 
253 aa  76.3  0.0000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>