204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3786 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_3786  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 
269 aa  557  1e-158  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4976  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.32 
 
 
266 aa  209  4e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000483065 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2702  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.87 
 
 
265 aa  203  3e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2528  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.44 
 
 
312 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.772852  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2988  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.08 
 
 
282 aa  157  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.685317  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2527  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.24 
 
 
576 aa  139  4.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0607  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.09 
 
 
253 aa  112  8.000000000000001e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3358  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.73 
 
 
298 aa  109  4.0000000000000004e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0905  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.71 
 
 
278 aa  100  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965687  normal  0.246268 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0904  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.68 
 
 
289 aa  99.8  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  0.240953 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1188  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.83 
 
 
837 aa  98.2  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0209  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.13 
 
 
283 aa  96.7  3e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5423  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.39 
 
 
242 aa  97.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313531  hitchhiker  0.0062358 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21370  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 
281 aa  95.9  7e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5127  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.84 
 
 
242 aa  95.1  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.0539363 
 
 
-
 
NC_002936  DET0108  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  34.14 
 
 
591 aa  92.4  7e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2384  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.04 
 
 
300 aa  91.7  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3513  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.63 
 
 
236 aa  91.3  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00703913  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2799  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.74 
 
 
244 aa  90.9  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5005  hypothetical protein  28.05 
 
 
245 aa  90.5  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4045  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.83 
 
 
242 aa  89.4  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0383  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.14 
 
 
266 aa  87.4  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2727  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.52 
 
 
246 aa  86.7  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.216689  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5493  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.78 
 
 
278 aa  86.7  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306278  hitchhiker  0.00234729 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5732  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.24 
 
 
300 aa  85.9  7e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.673881  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1514  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.2 
 
 
246 aa  85.5  9e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.126297 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2394  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30 
 
 
243 aa  85.1  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0791  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.44 
 
 
808 aa  83.6  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548418  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6090  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.74 
 
 
258 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18128  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.78 
 
 
263 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42531  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_118  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  31.98 
 
 
639 aa  81.3  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6501  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.78 
 
 
263 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.126817  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0260  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.33 
 
 
639 aa  80.5  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.61014  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4845  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.21 
 
 
283 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346949  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2555  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.07 
 
 
257 aa  79.3  0.00000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.337597  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2849  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.44 
 
 
644 aa  77.4  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00190481  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5307  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.48 
 
 
244 aa  77.4  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.68 
 
 
328 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.215897  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1972  metal-dependent hydrolase  33.18 
 
 
338 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6314  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.5 
 
 
269 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0901897 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5588  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.24 
 
 
269 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15644  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4386  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.27 
 
 
269 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4697  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.12 
 
 
328 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1880  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  33.18 
 
 
338 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.850381  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24010  metal-dependent hydrolase  30.04 
 
 
286 aa  72.8  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.078651 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5742  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.78 
 
 
233 aa  71.6  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0430039 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0808  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.58 
 
 
257 aa  71.6  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.555445  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0649  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  31.02 
 
 
250 aa  70.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.441021  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0800  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.02 
 
 
258 aa  70.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.179814  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2670  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.4 
 
 
260 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246537  normal  0.0515035 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25550  metal-dependent hydrolase  25.3 
 
 
657 aa  70.9  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.202364 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11000  metal-dependent hydrolase  30.15 
 
 
316 aa  70.5  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0408  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  32.48 
 
 
1153 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.352854  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3504  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.53 
 
 
285 aa  70.1  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.45027 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1343  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.76 
 
 
279 aa  65.5  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591358  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0962  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.52 
 
 
255 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0980  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.52 
 
 
255 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal  0.0626393 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5411  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.93 
 
 
250 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.746518 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0990  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.52 
 
 
255 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0147  metal-dependent hydrolase  27.24 
 
 
673 aa  63.9  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1140  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.33 
 
 
231 aa  63.5  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1422  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.57 
 
 
235 aa  63.2  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.329688 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0093  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.38 
 
 
294 aa  63.5  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0694  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.44 
 
 
256 aa  62.8  0.000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.4725  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3760  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.19 
 
 
249 aa  62  0.000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3253  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.22 
 
 
253 aa  61.6  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.378001  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0900  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.57 
 
 
257 aa  62  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3678  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.35 
 
 
437 aa  60.8  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.64554  normal  0.322426 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0781  hypothetical protein  31.44 
 
 
256 aa  61.2  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3653  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.2 
 
 
249 aa  60.5  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.477132  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2363  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.63 
 
 
255 aa  60.5  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4612  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.4 
 
 
268 aa  59.7  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0765415  normal  0.0123856 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2832  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.63 
 
 
260 aa  59.3  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.313269  decreased coverage  0.00271528 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2393  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.72 
 
 
277 aa  59.3  0.00000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0035  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.12 
 
 
290 aa  59.3  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.742577  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4191  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.95 
 
 
304 aa  59.3  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0935651  normal  0.0459934 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2639  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.89 
 
 
288 aa  58.2  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0201  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.53 
 
 
264 aa  58.2  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4026  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.14 
 
 
265 aa  58.2  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2679  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.35 
 
 
297 aa  58.2  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00635777  normal  0.660983 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6275  Metal-dependent hydrolase-like protein  22.53 
 
 
617 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0433121  decreased coverage  0.00812081 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0267  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.71 
 
 
291 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5198  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.24 
 
 
278 aa  57.4  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.440175 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0484  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.1 
 
 
370 aa  57.4  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3406  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.87 
 
 
245 aa  56.6  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.325788  normal  0.617389 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4928  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.18 
 
 
375 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1247  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.83 
 
 
437 aa  56.6  0.0000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3384  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.42 
 
 
349 aa  55.8  0.0000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.146257 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0824  endonuclease/exonuclease/phosphatase, putative  24.89 
 
 
431 aa  55.8  0.0000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0502024  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0340  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  28.14 
 
 
291 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4022  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.39 
 
 
271 aa  55.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3119  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.57 
 
 
271 aa  55.5  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.635423  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0496  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.11 
 
 
246 aa  55.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5100  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.15 
 
 
284 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0779207 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2166  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.98 
 
 
286 aa  55.1  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3204  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.74 
 
 
259 aa  54.3  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0086  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.03 
 
 
257 aa  53.9  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2849  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.83 
 
 
276 aa  54.3  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.942011  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2759  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.94 
 
 
232 aa  54.3  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.429259  decreased coverage  0.00000225225 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0858  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.1 
 
 
371 aa  53.9  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>