215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01462 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_01462  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 
233 aa  483  1e-136  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3731  endonuclease/exonuclease/phosphatase  55.51 
 
 
243 aa  271  7e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3204  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.19 
 
 
259 aa  132  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1473  hypothetical protein  33.62 
 
 
273 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.257293  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0201  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.02 
 
 
264 aa  129  3e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1422  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.75 
 
 
235 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.329688 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1524  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.09 
 
 
228 aa  122  4e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0870  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.35 
 
 
287 aa  122  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.282627  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5127  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.34 
 
 
242 aa  119  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.0539363 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5423  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.34 
 
 
242 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313531  hitchhiker  0.0062358 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2520  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.44 
 
 
232 aa  119  6e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1140  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.77 
 
 
231 aa  118  7.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6773  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.91 
 
 
271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.67063  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5493  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 
278 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306278  hitchhiker  0.00234729 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2865  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.89 
 
 
261 aa  115  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5411  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.89 
 
 
250 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.746518 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4026  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.6 
 
 
265 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2132  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.21 
 
 
226 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2772  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.47 
 
 
261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.472556  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6090  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32 
 
 
258 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18128  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2679  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.05 
 
 
282 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0692  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.48 
 
 
245 aa  112  6e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.221154  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32 
 
 
263 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42531  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6501  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32 
 
 
263 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.126817  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0997  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  32.77 
 
 
285 aa  112  7.000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0239  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.53 
 
 
258 aa  111  8.000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.577245  normal  0.289646 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1916  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.13 
 
 
230 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2363  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.53 
 
 
255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5868  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.21 
 
 
271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.432007  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1059  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  32.77 
 
 
285 aa  109  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0432754  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4045  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.49 
 
 
242 aa  109  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1324  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.62 
 
 
285 aa  108  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0807274  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2670  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.49 
 
 
260 aa  108  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246537  normal  0.0515035 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5588  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.67 
 
 
269 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15644  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0846  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.57 
 
 
292 aa  107  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6314  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.67 
 
 
269 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0901897 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1514  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.25 
 
 
246 aa  105  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.126297 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0003  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  30.84 
 
 
299 aa  105  5e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0383  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.05 
 
 
266 aa  105  7e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3253  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.69 
 
 
253 aa  103  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.378001  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2394  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.87 
 
 
240 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0672115  normal  0.448912 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5005  hypothetical protein  32.11 
 
 
245 aa  103  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2727  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.67 
 
 
246 aa  103  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.216689  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0420  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.41 
 
 
236 aa  101  9e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4059  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.17 
 
 
260 aa  101  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.67832 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2216  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.94 
 
 
243 aa  100  3e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0194229  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1880  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  33.16 
 
 
338 aa  99.4  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.850381  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1972  metal-dependent hydrolase  33.16 
 
 
338 aa  98.6  7e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3930  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.26 
 
 
247 aa  97.8  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0720293 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0472  hypothetical protein  29.13 
 
 
240 aa  96.7  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2124  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.13 
 
 
240 aa  96.7  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.908976 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5307  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.05 
 
 
244 aa  95.5  7e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1188  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.45 
 
 
837 aa  95.5  7e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0900  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.06 
 
 
257 aa  95.1  8e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.34 
 
 
328 aa  91.7  9e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.215897  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0408  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  33.16 
 
 
1153 aa  91.3  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.352854  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4697  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.34 
 
 
328 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0791  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.33 
 
 
808 aa  90.1  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548418  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2877  hypothetical protein  28.7 
 
 
277 aa  89.7  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2325  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.12 
 
 
231 aa  88.6  8e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.415298 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4022  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.17 
 
 
271 aa  86.3  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0496  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.64 
 
 
246 aa  85.5  6e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2515  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.17 
 
 
256 aa  84.3  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.764021  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0510  hypothetical protein  28.63 
 
 
257 aa  83.6  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3278  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.12 
 
 
261 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0445  endonuclease / exonuclease / phosphatase family protein  28.21 
 
 
251 aa  83.6  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.625659 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5036  aminoacyl-tRNA hydrolase  27.16 
 
 
265 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0185176 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36680  hypothetical protein  27.92 
 
 
245 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.21271  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4845  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.74 
 
 
283 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346949  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0048  hypothetical protein  30.49 
 
 
256 aa  83.2  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00965819  normal  0.1661 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0534  hypothetical protein  28.23 
 
 
257 aa  82.8  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2424  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.84 
 
 
253 aa  82.4  0.000000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.123297  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1327  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.22 
 
 
245 aa  82.8  0.000000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.51669  hitchhiker  0.00270426 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3504  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  27.69 
 
 
237 aa  82  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.40759  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4120  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.87 
 
 
250 aa  81.6  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3150  hypothetical protein  28.1 
 
 
245 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.610238  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1299  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.11 
 
 
252 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3653  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.44 
 
 
249 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.477132  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3760  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.44 
 
 
249 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3642  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.22 
 
 
249 aa  79.7  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.748827  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0080  hypothetical protein  26.09 
 
 
302 aa  79  0.00000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3616  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.89 
 
 
287 aa  78.6  0.00000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0442  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.8 
 
 
262 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0877  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.56 
 
 
255 aa  77.8  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0806  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.56 
 
 
255 aa  77.8  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.636912  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2238  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.56 
 
 
251 aa  78.2  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0086  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.79 
 
 
257 aa  77  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2799  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.33 
 
 
244 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0026  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.1 
 
 
267 aa  75.9  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5450  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.35 
 
 
257 aa  75.5  0.0000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1343  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.8 
 
 
279 aa  75.5  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591358  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1072  hypothetical protein  28.46 
 
 
270 aa  75.5  0.0000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.348031  normal  0.384131 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0469  hypothetical protein  27.69 
 
 
248 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.744864  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0606  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.23 
 
 
250 aa  75.1  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.374942  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2852  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.38 
 
 
253 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.350943  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0938  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  27.38 
 
 
253 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21370  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.16 
 
 
281 aa  73.9  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0381  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.71 
 
 
251 aa  74.3  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.853038  normal  0.111284 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0344  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.76 
 
 
248 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0854  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  27.38 
 
 
253 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>