169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0445 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0445  endonuclease / exonuclease / phosphatase family protein  100 
 
 		 251 aa  525  1e-148  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.625659 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0606  endonuclease/exonuclease/phosphatase  59.11 
 
 		 250 aa  314  7e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.374942  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3642  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  58.2 
 
 		 249 aa  297  8e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.748827  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2380  endonuclease/exonuclease/phosphatase  55.42 
 
 		 251 aa  277  1e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.835809 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3767  endonuclease/exonuclease/phosphatase  54.29 
 
 		 252 aa  268  5.9999999999999995e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0769557 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0048  hypothetical protein  48.76 
 
 		 256 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00965819  normal  0.1661 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3616  endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.77 
 
 		 287 aa  236  3e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2515  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  45.23 
 
 		 256 aa  232  4.0000000000000004e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.764021  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4298  endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.76 
 
 		 259 aa  232  5e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0014  endonuclease/exonuclease/phosphatase  46.31 
 
 		 277 aa  231  1e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.241981 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0026  endonuclease/exonuclease/phosphatase  45.45 
 
 		 267 aa  229  3e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00757  predicted DNase  45.08 
 
 		 253 aa  229  4e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00774  hypothetical protein  45.08 
 
 		 253 aa  229  4e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2853  endonuclease/exonuclease/phosphatase  45.08 
 
 		 253 aa  229  4e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00512011 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0844  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  45.08 
 
 		 253 aa  229  4e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2852  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  45.08 
 
 		 253 aa  229  5e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.350943  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0938  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  45.08 
 
 		 253 aa  229  5e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0813  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  45.08 
 
 		 253 aa  229  5e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0192282  normal  0.85473 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0854  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  45.08 
 
 		 253 aa  228  6e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2562  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  44.67 
 
 		 253 aa  223  2e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1281  endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.26 
 
 		 253 aa  223  2e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5036  aminoacyl-tRNA hydrolase  44.21 
 
 		 265 aa  223  3e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0185176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3007  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  45.9 
 
 		 279 aa  222  4.9999999999999996e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3724  endonuclease/exonuclease/phosphatase  45.9 
 
 		 279 aa  221  6e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.236792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2284  endonuclease/exonuclease/phosphatase  48.37 
 
 		 262 aa  221  9e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0656369  hitchhiker  0.000754964 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2495  endonuclease/exonuclease/phosphatase  45.49 
 
 		 257 aa  219  3e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0908  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  43.85 
 
 		 252 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0916506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0848  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  43.85 
 
 		 252 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0940  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  43.85 
 
 		 252 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00426171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0876  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  43.85 
 
 		 252 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0013  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.58 
 
 		 242 aa  219  3.9999999999999997e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.914403  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0961  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  43.85 
 
 		 252 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24830  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.13 
 
 		 276 aa  218  7.999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.669671  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3265  endonuclease/exonuclease/phosphatase  45.49 
 
 		 257 aa  217  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.585826  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2424  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.74 
 
 		 253 aa  217  2e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.123297  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2631  endonuclease/exonuclease/phosphatase  45.49 
 
 		 257 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363839 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36680  hypothetical protein  43.85 
 
 		 245 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.21271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3150  hypothetical protein  44.26 
 
 		 245 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.610238  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3278  endonuclease/exonuclease/phosphatase  45.75 
 
 		 261 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3504  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  46.64 
 
 		 237 aa  211  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.40759  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0086  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.15 
 
 		 257 aa  210  1e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2645  endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.26 
 
 		 261 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.150024  normal  0.299573 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2238  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.3 
 
 		 251 aa  209  3e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0080  hypothetical protein  41.74 
 
 		 302 aa  209  4e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2538  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.8 
 
 		 260 aa  205  5e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0510  hypothetical protein  41.56 
 
 		 257 aa  204  1e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0534  hypothetical protein  41.15 
 
 		 257 aa  203  2e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1391  endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.44 
 
 		 250 aa  202  5e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0469  hypothetical protein  46.12 
 
 		 248 aa  202  6e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.744864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0344  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.9 
 
 		 248 aa  201  6e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0359  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.9 
 
 		 248 aa  202  6e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3655  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.8 
 
 		 264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0227458 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4056  endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.03 
 
 		 264 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1787  endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.03 
 
 		 264 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.717183  normal  0.757673 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1158  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  41.06 
 
 		 255 aa  186  2e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.426304  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1028  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  40.65 
 
 		 255 aa  184  9e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0442  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.51 
 
 		 262 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0570  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  40 
 
 		 250 aa  183  2.0000000000000003e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.98478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0381  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.98 
 
 		 251 aa  177  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.853038  normal  0.111284 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0806  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.77 
 
 		 255 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.636912  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0877  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.77 
 
 		 255 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4120  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.13 
 
 		 250 aa  171  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3633  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.68 
 
 		 252 aa  169  4e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0240015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1327  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.41 
 
 		 245 aa  166  2.9999999999999998e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.51669  hitchhiker  0.00270426 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5450  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.92 
 
 		 257 aa  159  4e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1299  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.92 
 
 		 252 aa  152  4e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1072  hypothetical protein  38.1 
 
 		 270 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.348031  normal  0.384131 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4016  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.2 
 
 		 276 aa  143  3e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000734924 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3049  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.26 
 
 		 271 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.687036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2962  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.25 
 
 		 271 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.780318 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3096  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.25 
 
 		 271 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3071  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.9 
 
 		 271 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51453 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2438  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.9 
 
 		 271 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3052  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.9 
 
 		 271 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0429  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  34.38 
 
 		 270 aa  102  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0125577  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6399  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.23 
 
 		 271 aa  102  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2960  hypothetical protein  34.38 
 
 		 270 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2128  hypothetical protein  34.38 
 
 		 270 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0235  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  34.38 
 
 		 270 aa  102  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.102348  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0247  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  34.38 
 
 		 270 aa  102  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.324157  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3386  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  34.38 
 
 		 270 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0102  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.4 
 
 		 265 aa  102  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0384  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32 
 
 		 265 aa  96.7  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4337  putative metal-dependent hydrolase  32.28 
 
 		 265 aa  95.9  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3294  hypothetical protein  34.63 
 
 		 230 aa  95.9  6e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0213  hypothetical protein  34.2 
 
 		 230 aa  95.5  7e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0846  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.49 
 
 		 292 aa  92  9e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5411  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.13 
 
 		 250 aa  89.4  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.746518 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1473  hypothetical protein  28.57 
 
 		 273 aa  86.3  5e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.257293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2670  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.23 
 
 		 260 aa  84.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246537  normal  0.0515035 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5493  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.45 
 
 		 278 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306278  hitchhiker  0.00234729 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3731  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.91 
 
 		 243 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0496  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.6 
 
 		 246 aa  83.2  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21370  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.84 
 
 		 281 aa  83.6  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01462  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.21 
 
 		 233 aa  83.6  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2865  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.33 
 
 		 261 aa  82.8  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2384  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.38 
 
 		 300 aa  82.4  0.000000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1059  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  27.87 
 
 		 285 aa  82  0.000000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0432754  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1324  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.74 
 
 		 285 aa  81.3  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0807274  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2772  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.92 
 
 		 261 aa  81.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.472556  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>