236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4022 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_4022  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 
271 aa  535  1e-151  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24010  metal-dependent hydrolase  37.63 
 
 
286 aa  137  3.0000000000000003e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.078651 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11000  metal-dependent hydrolase  37.46 
 
 
316 aa  130  3e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0905  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.62 
 
 
278 aa  127  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965687  normal  0.246268 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0904  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.43 
 
 
289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  0.240953 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5198  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.43 
 
 
278 aa  124  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.440175 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2799  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.15 
 
 
244 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0383  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.4 
 
 
266 aa  118  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5005  hypothetical protein  34.51 
 
 
245 aa  115  6.9999999999999995e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.8 
 
 
328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.215897  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5423  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.11 
 
 
242 aa  112  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313531  hitchhiker  0.0062358 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4697  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.06 
 
 
328 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21370  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.29 
 
 
281 aa  110  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5127  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.58 
 
 
242 aa  109  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.0539363 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1188  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.59 
 
 
837 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4845  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.23 
 
 
283 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346949  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3513  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.51 
 
 
236 aa  106  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00703913  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4045  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.2 
 
 
242 aa  103  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2528  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.14 
 
 
312 aa  101  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.772852  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1343  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.15 
 
 
279 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591358  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2727  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 
246 aa  93.2  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.216689  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1514  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.56 
 
 
246 aa  91.7  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.126297 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0791  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.21 
 
 
808 aa  91.3  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548418  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1364  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 
301 aa  91.3  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.204083  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0900  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.46 
 
 
257 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0108  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  30.45 
 
 
591 aa  89.4  6e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4122  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30 
 
 
287 aa  88.6  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0260  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.19 
 
 
639 aa  87.8  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.61014  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01462  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.17 
 
 
233 aa  86.3  6e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2093  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.19 
 
 
284 aa  85.9  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1349  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.43 
 
 
287 aa  84.7  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.442404  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2527  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.04 
 
 
576 aa  85.1  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_118  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  29.06 
 
 
639 aa  84  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2113  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.23 
 
 
284 aa  83.2  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0578211  normal  0.225636 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3873  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.97 
 
 
288 aa  83.6  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0170416 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4976  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.96 
 
 
266 aa  82.4  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000483065 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1208  hypothetical protein  31.82 
 
 
289 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1473  hypothetical protein  35.37 
 
 
273 aa  81.3  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.257293  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0692  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.08 
 
 
245 aa  80.5  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.221154  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1140  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.91 
 
 
231 aa  80.1  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5411  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.8 
 
 
250 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.746518 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1438  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.58 
 
 
291 aa  79.7  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.626738 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0209  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.62 
 
 
283 aa  79.3  0.00000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4283  Metal-dependent exonuclease protein  27.12 
 
 
286 aa  78.6  0.00000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21864  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4197  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.75 
 
 
288 aa  78.6  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1524  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.47 
 
 
228 aa  78.6  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0201  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.44 
 
 
264 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1422  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.82 
 
 
235 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.329688 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2766  hypothetical protein  36.28 
 
 
281 aa  77.8  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2849  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.82 
 
 
276 aa  77.8  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.942011  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2670  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.91 
 
 
260 aa  77  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246537  normal  0.0515035 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.37 
 
 
263 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42531  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3731  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.74 
 
 
243 aa  77  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6501  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.37 
 
 
263 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.126817  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3760  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.3 
 
 
249 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2849  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.7 
 
 
644 aa  77  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00190481  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3204  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.08 
 
 
259 aa  76.3  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6314  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.43 
 
 
269 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0901897 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5588  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.79 
 
 
269 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15644  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6090  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.43 
 
 
258 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18128  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3653  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.3 
 
 
249 aa  75.5  0.0000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.477132  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1972  metal-dependent hydrolase  31.2 
 
 
338 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1880  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  31.2 
 
 
338 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.850381  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2702  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.1 
 
 
265 aa  74.7  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0408  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  31.75 
 
 
1153 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.352854  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0607  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.53 
 
 
253 aa  73.9  0.000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25550  metal-dependent hydrolase  31.25 
 
 
657 aa  72.8  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.202364 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5493  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.47 
 
 
278 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306278  hitchhiker  0.00234729 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3253  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.89 
 
 
253 aa  72.8  0.000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.378001  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3358  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.25 
 
 
298 aa  72.4  0.000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0147  metal-dependent hydrolase  28.15 
 
 
673 aa  71.6  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5302  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.49 
 
 
289 aa  71.6  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.974618 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3303  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.2 
 
 
291 aa  71.6  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5119  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.67 
 
 
284 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0533258  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2656  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.53 
 
 
291 aa  71.2  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.146328  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2988  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.93 
 
 
282 aa  70.9  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.685317  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0239  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.2 
 
 
258 aa  70.5  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.577245  normal  0.289646 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0093  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.27 
 
 
294 aa  69.7  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4026  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.74 
 
 
265 aa  69.3  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2601  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  30.69 
 
 
282 aa  68.9  0.00000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.792599  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2520  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.15 
 
 
232 aa  68.6  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1289  hypothetical protein  28.15 
 
 
290 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891999  normal  0.614576 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1756  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.17 
 
 
286 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5408  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.69 
 
 
634 aa  67  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.521256  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2132  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.01 
 
 
226 aa  67  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1144  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.96 
 
 
287 aa  67  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.703964  normal  0.394311 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3930  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.41 
 
 
247 aa  66.2  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0720293 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4024  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.95 
 
 
278 aa  65.9  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.284823  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2228  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  29 
 
 
286 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1324  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30 
 
 
285 aa  65.9  0.0000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0807274  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4612  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.63 
 
 
268 aa  65.5  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0765415  normal  0.0123856 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2865  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.01 
 
 
261 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2679  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.54 
 
 
282 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2772  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.01 
 
 
261 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.472556  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1729  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.02 
 
 
284 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.102373  normal  0.215205 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01980  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  32.22 
 
 
286 aa  63.9  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.496471  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2877  hypothetical protein  36.46 
 
 
277 aa  63.5  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2384  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.64 
 
 
300 aa  63.9  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1842  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.04 
 
 
284 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.108875 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2832  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.69 
 
 
260 aa  63.5  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.313269  decreased coverage  0.00271528 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>