230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0904 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0904  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 
289 aa  582  1.0000000000000001e-165  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  0.240953 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0905  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  53.79 
 
 
278 aa  286  4e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965687  normal  0.246268 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4022  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.43 
 
 
271 aa  137  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5198  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.47 
 
 
278 aa  136  4e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.440175 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21370  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.71 
 
 
281 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0108  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  35.97 
 
 
591 aa  125  6e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2799  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.48 
 
 
244 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0260  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.3 
 
 
639 aa  123  4e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.61014  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_118  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  34.39 
 
 
639 aa  122  8e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24010  metal-dependent hydrolase  32.82 
 
 
286 aa  115  8.999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.078651 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3513  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.69 
 
 
236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00703913  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3786  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.68 
 
 
269 aa  108  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11000  metal-dependent hydrolase  40.64 
 
 
316 aa  102  7e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4122  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30 
 
 
287 aa  97.8  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.7 
 
 
328 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.215897  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3358  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.48 
 
 
298 aa  96.7  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1349  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.37 
 
 
287 aa  96.7  5e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.442404  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2702  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.27 
 
 
265 aa  95.9  7e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2528  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.55 
 
 
312 aa  95.9  7e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.772852  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4697  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 
328 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0791  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.68 
 
 
808 aa  92.8  5e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548418  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2849  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.39 
 
 
644 aa  93.2  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00190481  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4845  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.38 
 
 
283 aa  92  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346949  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2988  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.24 
 
 
282 aa  90.9  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.685317  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0209  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.17 
 
 
283 aa  90.9  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3873  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.27 
 
 
288 aa  90.5  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0170416 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2527  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.67 
 
 
576 aa  88.2  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4197  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.79 
 
 
288 aa  87  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1514  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.94 
 
 
246 aa  86.3  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.126297 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4283  Metal-dependent exonuclease protein  30.48 
 
 
286 aa  86.3  6e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21864  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25550  metal-dependent hydrolase  28.72 
 
 
657 aa  85.5  9e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.202364 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4976  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.8 
 
 
266 aa  85.5  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000483065 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3046  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.14 
 
 
235 aa  84.7  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000889267  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2727  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.34 
 
 
246 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.216689  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4045  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.67 
 
 
242 aa  83.6  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2384  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.72 
 
 
300 aa  83.6  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1188  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.04 
 
 
837 aa  82.8  0.000000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1072  hypothetical protein  29.89 
 
 
270 aa  82.8  0.000000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.348031  normal  0.384131 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0383  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.46 
 
 
266 aa  81.6  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0877  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.45 
 
 
255 aa  81.3  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5423  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.09 
 
 
242 aa  80.9  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313531  hitchhiker  0.0062358 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0806  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.45 
 
 
255 aa  81.3  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.636912  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5127  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.69 
 
 
242 aa  80.5  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.0539363 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5005  hypothetical protein  30.62 
 
 
245 aa  80.1  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1327  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.13 
 
 
245 aa  79  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.51669  hitchhiker  0.00270426 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2670  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.69 
 
 
260 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246537  normal  0.0515035 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5493  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.79 
 
 
278 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306278  hitchhiker  0.00234729 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0900  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.45 
 
 
257 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2363  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.24 
 
 
255 aa  76.3  0.0000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1343  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.23 
 
 
279 aa  75.9  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591358  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2865  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.2 
 
 
261 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2772  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.79 
 
 
261 aa  73.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.472556  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4120  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.56 
 
 
250 aa  73.2  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2679  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.79 
 
 
282 aa  72.4  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3633  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.29 
 
 
252 aa  71.6  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0240015  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2702  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.56 
 
 
232 aa  71.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0273908  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1289  hypothetical protein  26.8 
 
 
290 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891999  normal  0.614576 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0980  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.52 
 
 
249 aa  70.9  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0478352  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2555  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.74 
 
 
257 aa  71.2  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.337597  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5450  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.29 
 
 
257 aa  70.5  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1140  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.17 
 
 
231 aa  70.1  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1364  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.03 
 
 
301 aa  69.3  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.204083  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.15 
 
 
263 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42531  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6501  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.15 
 
 
263 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.126817  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3798  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.68 
 
 
263 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00159012  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4026  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.34 
 
 
265 aa  68.2  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3253  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.12 
 
 
253 aa  68.2  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.378001  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0800  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.06 
 
 
258 aa  67.8  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.179814  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0649  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  29.06 
 
 
250 aa  67.8  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.441021  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5119  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.17 
 
 
284 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0533258  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3678  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.13 
 
 
437 aa  67.8  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.64554  normal  0.322426 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4612  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.45 
 
 
268 aa  67.4  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0765415  normal  0.0123856 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6090  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.71 
 
 
258 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18128  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1299  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.25 
 
 
252 aa  66.6  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0964  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.34 
 
 
287 aa  67  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.444037  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0496  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.25 
 
 
246 aa  65.9  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1972  metal-dependent hydrolase  34.94 
 
 
338 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0990  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.54 
 
 
255 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1880  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  34.94 
 
 
338 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.850381  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0808  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.51 
 
 
257 aa  64.3  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.555445  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0201  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.24 
 
 
264 aa  64.7  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0962  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.27 
 
 
255 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0980  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.27 
 
 
255 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal  0.0626393 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3119  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.97 
 
 
271 aa  63.9  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.635423  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2832  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.9 
 
 
260 aa  63.9  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.313269  decreased coverage  0.00271528 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1756  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.44 
 
 
286 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4016  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.04 
 
 
276 aa  63.9  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000734924 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1729  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.17 
 
 
284 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.102373  normal  0.215205 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2113  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.43 
 
 
284 aa  63.5  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0578211  normal  0.225636 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5742  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.86 
 
 
233 aa  63.2  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0430039 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1034  hypothetical protein  28.52 
 
 
232 aa  62.8  0.000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0859  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.43 
 
 
367 aa  62.4  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0534  hypothetical protein  24.8 
 
 
257 aa  62.4  0.000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0510  hypothetical protein  24.8 
 
 
257 aa  62  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1842  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.44 
 
 
284 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.108875 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1059  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  29.37 
 
 
285 aa  60.8  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0432754  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0408  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  35.12 
 
 
1153 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.352854  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3653  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.29 
 
 
249 aa  60.8  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.477132  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0997  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  29.37 
 
 
285 aa  61.6  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1818  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.44 
 
 
284 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.543499  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>