97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2093 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2093  endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 		 284 aa  585  1e-166  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2113  endonuclease/exonuclease/phosphatase  73.59 
 
 		 284 aa  442  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0578211  normal  0.225636 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5119  endonuclease/exonuclease/phosphatase  57.39 
 
 		 284 aa  318  7e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0533258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1455  endonuclease/exonuclease/phosphatase  55.28 
 
 		 285 aa  311  4.999999999999999e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271612  normal  0.540274 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6261  endonuclease/exonuclease/phosphatase  56.34 
 
 		 284 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1818  endonuclease/exonuclease/phosphatase  56.34 
 
 		 284 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.543499  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1729  endonuclease/exonuclease/phosphatase  54.74 
 
 		 284 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.102373  normal  0.215205 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1756  endonuclease/exonuclease/phosphatase  53.85 
 
 		 286 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1842  endonuclease/exonuclease/phosphatase  55.28 
 
 		 284 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.108875 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1289  hypothetical protein  53.45 
 
 		 290 aa  297  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891999  normal  0.614576 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2228  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  55.28 
 
 		 286 aa  291  9e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0964  endonuclease/exonuclease/phosphatase  52.61 
 
 		 287 aa  287  1e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.444037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2196  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  53.17 
 
 		 286 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.420987  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1114  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  53.17 
 
 		 286 aa  279  4e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0055  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  53.17 
 
 		 286 aa  279  4e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.322839  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2234  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  53.17 
 
 		 286 aa  279  4e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.187821  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1350.1  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  53.17 
 
 		 324 aa  278  7e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0665906  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2361  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  52.82 
 
 		 286 aa  278  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.602573  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1842  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  52.82 
 
 		 286 aa  276  3e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1208  hypothetical protein  51.24 
 
 		 289 aa  260  2e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1144  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.7 
 
 		 287 aa  249  3e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.703964  normal  0.394311 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1052  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.7 
 
 		 287 aa  248  9e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00191941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2766  hypothetical protein  46.64 
 
 		 281 aa  244  9.999999999999999e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1364  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  46.02 
 
 		 301 aa  227  1e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.204083  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3303  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.54 
 
 		 291 aa  227  2e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2656  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.86 
 
 		 291 aa  223  4e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.146328  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2351  hypothetical protein  55.05 
 
 		 226 aa  217  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.286388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5302  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.45 
 
 		 289 aa  213  2.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.974618 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1349  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.02 
 
 		 287 aa  108  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.442404  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4283  Metal-dependent exonuclease protein  29.97 
 
 		 286 aa  102  7e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21864  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4122  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.02 
 
 		 287 aa  101  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4197  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.9 
 
 		 288 aa  97.8  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3873  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.15 
 
 		 288 aa  93.2  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0170416 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4022  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.19 
 
 		 271 aa  85.9  7e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.37 
 
 		 328 aa  68.9  0.00000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.215897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11000  metal-dependent hydrolase  32.89 
 
 		 316 aa  68.2  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4697  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.33 
 
 		 328 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4612  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.67 
 
 		 268 aa  65.1  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0765415  normal  0.0123856 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5127  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.95 
 
 		 242 aa  62  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.0539363 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0383  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.3 
 
 		 266 aa  62  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25550  metal-dependent hydrolase  34.78 
 
 		 657 aa  61.2  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.202364 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0791  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.34 
 
 		 808 aa  60.5  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2670  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.07 
 
 		 260 aa  59.3  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246537  normal  0.0515035 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4845  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.33 
 
 		 283 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0201  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.24 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5423  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.5 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313531  hitchhiker  0.0062358 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1188  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.61 
 
 		 837 aa  55.5  0.0000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5408  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.92 
 
 		 634 aa  55.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.521256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0900  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.28 
 
 		 257 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2520  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.08 
 
 		 232 aa  54.3  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3930  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.12 
 
 		 247 aa  53.9  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0720293 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6275  Metal-dependent hydrolase-like protein  26.86 
 
 		 617 aa  53.5  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0433121  decreased coverage  0.00812081 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2799  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.64 
 
 		 244 aa  53.5  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21370  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.83 
 
 		 281 aa  53.5  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24010  metal-dependent hydrolase  27.49 
 
 		 286 aa  53.1  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.078651 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1422  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.5 
 
 		 235 aa  52.8  0.000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.329688 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1473  hypothetical protein  32.26 
 
 		 273 aa  52.4  0.000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.257293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1343  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.74 
 
 		 279 aa  52  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591358  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3513  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.18 
 
 		 236 aa  51.2  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00703913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1524  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.32 
 
 		 228 aa  51.6  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2832  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.88 
 
 		 260 aa  51.6  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.313269  decreased coverage  0.00271528 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0904  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.43 
 
 		 289 aa  50.4  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  0.240953 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5732  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.27 
 
 		 300 aa  50.4  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.673881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2363  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.48 
 
 		 255 aa  50.1  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2528  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.63 
 
 		 312 aa  48.9  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.772852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2132  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.87 
 
 		 226 aa  48.9  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0692  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.31 
 
 		 245 aa  48.5  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.221154  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4026  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.68 
 
 		 265 aa  48.9  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2325  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.85 
 
 		 231 aa  48.9  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.415298 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3253  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.87 
 
 		 253 aa  47.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.378001  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2394  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.91 
 
 		 243 aa  47.8  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1140  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.57 
 
 		 231 aa  47.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5005  hypothetical protein  24.57 
 
 		 245 aa  47.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5198  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28 
 
 		 278 aa  47.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.440175 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2727  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.31 
 
 		 246 aa  47.4  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.216689  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0870  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.72 
 
 		 287 aa  47.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.282627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1880  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  31.17 
 
 		 338 aa  47.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.850381  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1514  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.96 
 
 		 246 aa  47  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.126297 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1972  metal-dependent hydrolase  31.17 
 
 		 338 aa  47.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2527  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25 
 
 		 576 aa  46.6  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3504  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.69 
 
 		 285 aa  46.2  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.45027 
 
 
-
 
NC_002936  DET0108  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  28.44 
 
 		 591 aa  46.2  0.0006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0496  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.56 
 
 		 246 aa  45.8  0.0009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0408  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  31.17 
 
 		 1153 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.352854  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3786  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.86 
 
 		 269 aa  45.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2849  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.52 
 
 		 644 aa  44.3  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00190481  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0260  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.11 
 
 		 639 aa  44.7  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.61014  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4045  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.74 
 
 		 242 aa  44.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5493  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.22 
 
 		 278 aa  43.5  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306278  hitchhiker  0.00234729 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3358  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.42 
 
 		 298 aa  44.3  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6090  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.68 
 
 		 258 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6501  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.68 
 
 		 263 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.126817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.68 
 
 		 263 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42531  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0846  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.17 
 
 		 292 aa  43.1  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2394  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.1 
 
 		 240 aa  42.7  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0672115  normal  0.448912 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_118  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  24.88 
 
 		 639 aa  42.4  0.009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1434  exodeoxyribonuclease III Xth  28.07 
 
 		 248 aa  42.4  0.01  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>