78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_1818 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_1818  endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 		 284 aa  565  1e-160  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.543499  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6261  endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 		 284 aa  565  1e-160  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1842  endonuclease/exonuclease/phosphatase  95.42 
 
 		 284 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.108875 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5119  endonuclease/exonuclease/phosphatase  89.08 
 
 		 284 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0533258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1729  endonuclease/exonuclease/phosphatase  83.04 
 
 		 284 aa  484  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.102373  normal  0.215205 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1756  endonuclease/exonuclease/phosphatase  83.04 
 
 		 286 aa  486  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1455  endonuclease/exonuclease/phosphatase  81.27 
 
 		 285 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271612  normal  0.540274 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1350.1  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  72.44 
 
 		 324 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0665906  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1114  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  72.18 
 
 		 286 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2234  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  72.18 
 
 		 286 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.187821  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2196  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  71.83 
 
 		 286 aa  396  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.420987  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0055  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  72.18 
 
 		 286 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.322839  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1842  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  71.83 
 
 		 286 aa  394  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2361  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  71.83 
 
 		 286 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.602573  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2228  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  71.02 
 
 		 286 aa  393  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0964  endonuclease/exonuclease/phosphatase  66.2 
 
 		 287 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.444037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1289  hypothetical protein  61.59 
 
 		 290 aa  358  7e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891999  normal  0.614576 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2093  endonuclease/exonuclease/phosphatase  56.34 
 
 		 284 aa  307  1.0000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2113  endonuclease/exonuclease/phosphatase  54.96 
 
 		 284 aa  296  3e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0578211  normal  0.225636 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1144  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  49.3 
 
 		 287 aa  263  2e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.703964  normal  0.394311 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1052  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  49.3 
 
 		 287 aa  260  2e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00191941  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1208  hypothetical protein  51.57 
 
 		 289 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2766  hypothetical protein  50.35 
 
 		 281 aa  258  8e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2351  hypothetical protein  57.67 
 
 		 226 aa  251  7e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.286388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1364  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.52 
 
 		 301 aa  211  1e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.204083  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3303  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.39 
 
 		 291 aa  210  3e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2656  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.33 
 
 		 291 aa  208  1e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.146328  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5302  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.59 
 
 		 289 aa  184  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.974618 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4122  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.94 
 
 		 287 aa  97.8  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1349  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.27 
 
 		 287 aa  97.8  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.442404  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4283  Metal-dependent exonuclease protein  29.77 
 
 		 286 aa  95.1  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21864  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4197  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.64 
 
 		 288 aa  88.2  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3873  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.71 
 
 		 288 aa  80.5  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0170416 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11000  metal-dependent hydrolase  38.99 
 
 		 316 aa  63.5  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4697  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.31 
 
 		 328 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4022  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.11 
 
 		 271 aa  62.8  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.31 
 
 		 328 aa  62.4  0.000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.215897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3504  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.33 
 
 		 285 aa  61.6  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.45027 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5198  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.86 
 
 		 278 aa  62  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.440175 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0905  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.24 
 
 		 278 aa  59.3  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965687  normal  0.246268 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0904  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.44 
 
 		 289 aa  58.5  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  0.240953 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5127  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.87 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.0539363 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.02 
 
 		 263 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42531  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6501  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.02 
 
 		 263 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.126817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4845  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.03 
 
 		 283 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5423  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.53 
 
 		 242 aa  52.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313531  hitchhiker  0.0062358 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6090  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.4 
 
 		 258 aa  52.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1422  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.71 
 
 		 235 aa  52.4  0.000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.329688 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4024  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.42 
 
 		 278 aa  52  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.284823  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1140  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.42 
 
 		 231 aa  50.8  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4612  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.39 
 
 		 268 aa  50.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0765415  normal  0.0123856 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0408  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  33.54 
 
 		 1153 aa  50.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.352854  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1880  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  33.54 
 
 		 338 aa  50.4  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.850381  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1972  metal-dependent hydrolase  33.54 
 
 		 338 aa  50.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11640  exodeoxyribonuclease III  28.3 
 
 		 262 aa  48.1  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5411  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.18 
 
 		 250 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.746518 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2363  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.01 
 
 		 255 aa  47.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5588  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.54 
 
 		 269 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6314  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.54 
 
 		 269 aa  47.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0901897 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2988  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.48 
 
 		 282 aa  47.4  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.685317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5493  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.16 
 
 		 278 aa  46.6  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306278  hitchhiker  0.00234729 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5408  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.67 
 
 		 634 aa  46.2  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.521256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2528  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.22 
 
 		 312 aa  46.2  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.772852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1188  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.98 
 
 		 837 aa  45.8  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0980  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.57 
 
 		 255 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal  0.0626393 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0962  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.57 
 
 		 255 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2132  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.87 
 
 		 226 aa  45.4  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4386  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.23 
 
 		 269 aa  45.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0383  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.56 
 
 		 266 aa  44.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4594  exodeoxyribonuclease III Xth  27.13 
 
 		 268 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.136344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25550  metal-dependent hydrolase  31.9 
 
 		 657 aa  43.9  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.202364 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3930  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.22 
 
 		 247 aa  43.9  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0720293 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0990  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.02 
 
 		 255 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0147  metal-dependent hydrolase  23.81 
 
 		 673 aa  43.5  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2832  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.1 
 
 		 260 aa  43.1  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.313269  decreased coverage  0.00271528 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24010  metal-dependent hydrolase  28.18 
 
 		 286 aa  42.7  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.078651 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0656  exodeoxyribonuclease III Xth  25.74 
 
 		 262 aa  42.7  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.512718  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2271  exodeoxyribonuclease III Xth  32.29 
 
 		 252 aa  42.4  0.009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>