70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3504 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3504  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 		 285 aa  565  1e-160  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.45027 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4024  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.88 
 
 		 278 aa  83.6  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.284823  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1438  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.42 
 
 		 291 aa  82.8  0.000000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.626738 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3786  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.53 
 
 		 269 aa  70.1  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4075  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.51 
 
 		 325 aa  69.7  0.00000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2679  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.72 
 
 		 297 aa  63.9  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00635777  normal  0.660983 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0905  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.56 
 
 		 278 aa  63.5  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965687  normal  0.246268 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2988  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.83 
 
 		 282 aa  62  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.685317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1818  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.33 
 
 		 284 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.543499  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6261  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.33 
 
 		 284 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0209  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.19 
 
 		 283 aa  60.8  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11000  metal-dependent hydrolase  30.46 
 
 		 316 aa  59.7  0.00000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1842  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.1 
 
 		 284 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.108875 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5119  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.1 
 
 		 284 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0533258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5198  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.07 
 
 		 278 aa  57.4  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.440175 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2702  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.18 
 
 		 265 aa  56.2  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0904  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.56 
 
 		 289 aa  53.5  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  0.240953 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2394  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.99 
 
 		 243 aa  53.1  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0483  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  21.8 
 
 		 263 aa  52  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.307192  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2384  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.6 
 
 		 300 aa  52  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0415  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  22.81 
 
 		 263 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000792393 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0260  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.86 
 
 		 639 aa  52  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.61014  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0349  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  22.81 
 
 		 263 aa  52  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000480173  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0258  exodeoxyribonuclease III  27.48 
 
 		 264 aa  51.2  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0433178  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0108  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  27.63 
 
 		 591 aa  50.4  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4022  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.2 
 
 		 271 aa  50.8  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1729  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.96 
 
 		 284 aa  50.4  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.102373  normal  0.215205 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2766  hypothetical protein  34.25 
 
 		 281 aa  50.4  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1289  hypothetical protein  29.34 
 
 		 290 aa  50.4  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891999  normal  0.614576 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0607  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.13 
 
 		 253 aa  50.1  0.00004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0345  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  22.46 
 
 		 263 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.280877  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0354  endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.49 
 
 		 263 aa  50.1  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0478612  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0373  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  22.11 
 
 		 263 aa  49.7  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.888457  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1756  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.45 
 
 		 286 aa  49.7  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0359  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  21.75 
 
 		 263 aa  49.3  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.59313  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24010  metal-dependent hydrolase  29.17 
 
 		 286 aa  48.9  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.078651 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4976  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.18 
 
 		 266 aa  48.9  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000483065 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0964  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.73 
 
 		 287 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.444037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2113  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.52 
 
 		 284 aa  48.5  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0578211  normal  0.225636 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0472  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  21.8 
 
 		 263 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.289235  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1188  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.11 
 
 		 837 aa  47.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3358  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.22 
 
 		 298 aa  47.4  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0381  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.11 
 
 		 251 aa  47.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.853038  normal  0.111284 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1455  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.38 
 
 		 285 aa  47  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271612  normal  0.540274 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2380  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.14 
 
 		 251 aa  46.6  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.835809 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2893  exodeoxyribonuclease III Xth  26.51 
 
 		 269 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2093  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.69 
 
 		 284 aa  46.2  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2528  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.11 
 
 		 312 aa  46.2  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.772852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21370  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.52 
 
 		 281 aa  45.8  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2228  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  29.83 
 
 		 286 aa  45.8  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4910  exodeoxyribonuclease III Xth  26.25 
 
 		 269 aa  45.8  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0832655  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2196  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  29.41 
 
 		 286 aa  45.8  0.0009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.420987  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2234  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  29.41 
 
 		 286 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.187821  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1114  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  29.41 
 
 		 286 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0055  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  29.41 
 
 		 286 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.322839  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3153  exodeoxyribonuclease III Xth  26.44 
 
 		 264 aa  45.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000272901  hitchhiker  0.000542598 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1350.1  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  29.41 
 
 		 324 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0665906  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_118  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  26.5 
 
 		 639 aa  45.4  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0808  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.67 
 
 		 257 aa  44.3  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.555445  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0900  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.72 
 
 		 257 aa  44.3  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0442  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.28 
 
 		 262 aa  43.9  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1052  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.77 
 
 		 287 aa  43.9  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00191941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2849  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.83 
 
 		 644 aa  43.5  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00190481  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2361  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  28.99 
 
 		 286 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.602573  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4283  Metal-dependent exonuclease protein  32.2 
 
 		 286 aa  43.1  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21864  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0085  exodeoxyribonuclease III xth  28.03 
 
 		 295 aa  43.1  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.780104  normal  0.0810533 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5423  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.53 
 
 		 242 aa  42.7  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313531  hitchhiker  0.0062358 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.24 
 
 		 328 aa  42.4  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.215897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1364  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.86 
 
 		 301 aa  42.4  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.204083  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2424  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.44 
 
 		 253 aa  42  0.01  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.123297  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>