177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0108 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0108  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  100 
 
 
591 aa  1164    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_118  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  93.06 
 
 
639 aa  1062    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0260  endonuclease/exonuclease/phosphatase  85.62 
 
 
639 aa  996    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.61014  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2849  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.47 
 
 
644 aa  168  2.9999999999999998e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00190481  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0905  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.57 
 
 
278 aa  130  5.0000000000000004e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965687  normal  0.246268 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0147  metal-dependent hydrolase  28.08 
 
 
673 aa  125  3e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0904  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.21 
 
 
289 aa  123  9e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  0.240953 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6275  Metal-dependent hydrolase-like protein  27.87 
 
 
617 aa  117  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0433121  decreased coverage  0.00812081 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5408  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.25 
 
 
634 aa  104  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.521256  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24010  metal-dependent hydrolase  33.2 
 
 
286 aa  104  5e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.078651 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21370  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.95 
 
 
281 aa  101  4e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5198  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.18 
 
 
278 aa  100  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.440175 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2528  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.12 
 
 
312 aa  93.6  8e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.772852  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3786  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.14 
 
 
269 aa  92.4  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0383  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.35 
 
 
266 aa  92.4  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2799  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.22 
 
 
244 aa  91.3  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4022  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.15 
 
 
271 aa  89  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3513  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.61 
 
 
236 aa  88.6  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00703913  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1188  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.3 
 
 
837 aa  86.7  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2702  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.76 
 
 
265 aa  85.5  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0791  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.98 
 
 
808 aa  82  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548418  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4976  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.1 
 
 
266 aa  78.2  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000483065 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2988  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.65 
 
 
282 aa  77.8  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.685317  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1438  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.86 
 
 
291 aa  76.3  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.626738 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0607  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.99 
 
 
253 aa  73.9  0.000000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2865  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.28 
 
 
261 aa  73.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2772  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.28 
 
 
261 aa  73.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.472556  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5127  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.17 
 
 
242 aa  73.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.0539363 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4045  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.71 
 
 
242 aa  72.4  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2670  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.87 
 
 
260 aa  72.8  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246537  normal  0.0515035 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5423  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.05 
 
 
242 aa  72  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313531  hitchhiker  0.0062358 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1514  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.83 
 
 
246 aa  71.6  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.126297 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2727  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.17 
 
 
246 aa  71.2  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.216689  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1140  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.71 
 
 
231 aa  70.9  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3873  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.27 
 
 
288 aa  70.5  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0170416 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4197  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.64 
 
 
288 aa  69.7  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1343  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.31 
 
 
279 aa  69.3  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591358  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3358  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.44 
 
 
298 aa  68.6  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5493  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.62 
 
 
278 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306278  hitchhiker  0.00234729 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2679  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.45 
 
 
282 aa  67.8  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4845  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.62 
 
 
283 aa  68.2  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346949  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0900  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.6 
 
 
257 aa  67.4  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3760  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.57 
 
 
249 aa  67  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3204  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.46 
 
 
259 aa  67  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4026  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.15 
 
 
265 aa  67  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 
263 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42531  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6501  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 
263 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.126817  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5732  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.2 
 
 
300 aa  65.1  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.673881  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0800  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.29 
 
 
258 aa  65.5  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.179814  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2384  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.36 
 
 
300 aa  65.5  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0048  hypothetical protein  30.04 
 
 
256 aa  65.1  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00965819  normal  0.1661 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1972  metal-dependent hydrolase  35.85 
 
 
338 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1880  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  35.85 
 
 
338 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.850381  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0649  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  32.29 
 
 
250 aa  65.1  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.441021  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1349  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.96 
 
 
287 aa  65.1  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.442404  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5588  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.88 
 
 
269 aa  65.1  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15644  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4283  Metal-dependent exonuclease protein  28.05 
 
 
286 aa  65.1  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21864  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0008  hypothetical protein  31.29 
 
 
244 aa  63.9  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000326697  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3653  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.05 
 
 
249 aa  63.9  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.477132  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4612  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.74 
 
 
268 aa  63.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0765415  normal  0.0123856 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3633  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.24 
 
 
252 aa  63.2  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0240015  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6090  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.7 
 
 
258 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18128  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4697  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.6 
 
 
328 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6314  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.52 
 
 
269 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0901897 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5005  hypothetical protein  26.51 
 
 
245 aa  62  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2527  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.22 
 
 
576 aa  62  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4122  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.44 
 
 
287 aa  61.2  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0209  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.73 
 
 
283 aa  61.6  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3150  hypothetical protein  33.91 
 
 
245 aa  60.8  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.610238  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4056  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.94 
 
 
264 aa  60.8  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1787  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.94 
 
 
264 aa  60.8  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.717183  normal  0.757673 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3655  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.34 
 
 
264 aa  60.8  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0227458 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3616  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.89 
 
 
287 aa  60.5  0.00000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1524  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.5 
 
 
228 aa  59.7  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36680  hypothetical protein  33.91 
 
 
245 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.21271  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6062  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.92 
 
 
236 aa  60.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.640142  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0484  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.97 
 
 
370 aa  59.3  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0408  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  37.6 
 
 
1153 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.352854  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2538  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.23 
 
 
260 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0026  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.14 
 
 
267 aa  58.9  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2555  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.46 
 
 
257 aa  58.2  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.337597  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3007  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.91 
 
 
279 aa  58.2  0.0000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3724  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.91 
 
 
279 aa  57.8  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.236792  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2363  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.45 
 
 
255 aa  57.4  0.0000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0344  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.6 
 
 
248 aa  57.4  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0201  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26 
 
 
264 aa  56.6  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.52 
 
 
328 aa  57  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.215897  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0359  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.6 
 
 
248 aa  56.2  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0858  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.68 
 
 
371 aa  56.6  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0013  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.72 
 
 
242 aa  56.2  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.914403  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2919  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.9 
 
 
312 aa  56.2  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000384293  hitchhiker  0.000191262 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11000  metal-dependent hydrolase  28.93 
 
 
316 aa  55.8  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5307  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.76 
 
 
244 aa  56.2  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3278  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.21 
 
 
261 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24830  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.4 
 
 
276 aa  55.1  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.669671  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2284  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.79 
 
 
262 aa  54.7  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0656369  hitchhiker  0.000754964 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2515  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.45 
 
 
256 aa  54.3  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.764021  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4024  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.46 
 
 
278 aa  54.3  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.284823  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6773  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.16 
 
 
271 aa  53.9  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.67063  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2679  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.26 
 
 
297 aa  53.1  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00635777  normal  0.660983 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>