70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I2228 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007651  BTH_I2228  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  100 
 
 		 286 aa  578  1e-164  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1350.1  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  94.39 
 
 		 324 aa  523  1e-148  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0665906  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2234  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  94.39 
 
 		 286 aa  525  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.187821  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2196  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  94.04 
 
 		 286 aa  524  1e-148  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.420987  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0055  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  94.39 
 
 		 286 aa  525  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.322839  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1114  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  94.39 
 
 		 286 aa  525  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2361  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  94.04 
 
 		 286 aa  523  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.602573  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1842  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  94.04 
 
 		 286 aa  522  1e-147  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5119  endonuclease/exonuclease/phosphatase  73.94 
 
 		 284 aa  432  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0533258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1729  endonuclease/exonuclease/phosphatase  71.48 
 
 		 284 aa  418  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.102373  normal  0.215205 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1756  endonuclease/exonuclease/phosphatase  71.48 
 
 		 286 aa  418  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1842  endonuclease/exonuclease/phosphatase  71.02 
 
 		 284 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.108875 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6261  endonuclease/exonuclease/phosphatase  71.02 
 
 		 284 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1818  endonuclease/exonuclease/phosphatase  71.02 
 
 		 284 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.543499  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1455  endonuclease/exonuclease/phosphatase  70.88 
 
 		 285 aa  409  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271612  normal  0.540274 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0964  endonuclease/exonuclease/phosphatase  66.78 
 
 		 287 aa  379  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.444037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1289  hypothetical protein  58.13 
 
 		 290 aa  333  3e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891999  normal  0.614576 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2093  endonuclease/exonuclease/phosphatase  55.28 
 
 		 284 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2113  endonuclease/exonuclease/phosphatase  54.61 
 
 		 284 aa  285  5e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0578211  normal  0.225636 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1208  hypothetical protein  50.34 
 
 		 289 aa  258  7e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1052  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.9 
 
 		 287 aa  251  8.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00191941  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1144  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.74 
 
 		 287 aa  251  9.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.703964  normal  0.394311 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2766  hypothetical protein  48.24 
 
 		 281 aa  249  5e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2351  hypothetical protein  57.36 
 
 		 226 aa  231  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.286388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3303  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.62 
 
 		 291 aa  211  7.999999999999999e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2656  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.23 
 
 		 291 aa  211  1e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.146328  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1364  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.33 
 
 		 301 aa  204  9e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.204083  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5302  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.76 
 
 		 289 aa  182  4.0000000000000006e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.974618 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4122  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.39 
 
 		 287 aa  107  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1349  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.94 
 
 		 287 aa  100  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.442404  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4283  Metal-dependent exonuclease protein  28.76 
 
 		 286 aa  93.6  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21864  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3873  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.61 
 
 		 288 aa  83.2  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0170416 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4197  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.29 
 
 		 288 aa  82.4  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11000  metal-dependent hydrolase  38.41 
 
 		 316 aa  74.7  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4022  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.67 
 
 		 271 aa  70.9  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5198  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.75 
 
 		 278 aa  70.5  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.440175 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4697  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.66 
 
 		 328 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.17 
 
 		 328 aa  65.5  0.0000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.215897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1422  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.46 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.329688 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4024  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.63 
 
 		 278 aa  55.5  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.284823  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1140  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.9 
 
 		 231 aa  54.7  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0905  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.24 
 
 		 278 aa  53.1  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965687  normal  0.246268 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4026  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.88 
 
 		 265 aa  50.4  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4845  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.8 
 
 		 283 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.4 
 
 		 263 aa  50.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42531  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6501  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.4 
 
 		 263 aa  50.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.126817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3504  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.9 
 
 		 285 aa  49.7  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.45027 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6090  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.05 
 
 		 258 aa  48.9  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18128  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3678  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.33 
 
 		 437 aa  48.9  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.64554  normal  0.322426 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0904  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.34 
 
 		 289 aa  48.1  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  0.240953 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2832  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 		 260 aa  48.1  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.313269  decreased coverage  0.00271528 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0383  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.87 
 
 		 266 aa  47.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1972  metal-dependent hydrolase  29.22 
 
 		 338 aa  46.2  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1174  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.07 
 
 		 257 aa  45.8  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.834262  normal  0.168848 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2132  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.65 
 
 		 226 aa  45.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4386  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.65 
 
 		 269 aa  45.4  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0990  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.65 
 
 		 255 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0408  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  31.41 
 
 		 1153 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.352854  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0962  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.65 
 
 		 255 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0980  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.65 
 
 		 255 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal  0.0626393 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1880  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  29.63 
 
 		 338 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.850381  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0147  metal-dependent hydrolase  26.27 
 
 		 673 aa  43.9  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5423  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.92 
 
 		 242 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313531  hitchhiker  0.0062358 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25550  metal-dependent hydrolase  32.32 
 
 		 657 aa  43.9  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.202364 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1524  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.68 
 
 		 228 aa  43.9  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5493  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.64 
 
 		 278 aa  43.1  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306278  hitchhiker  0.00234729 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5588  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.99 
 
 		 269 aa  42.7  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2988  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.14 
 
 		 282 aa  42.4  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.685317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6275  Metal-dependent hydrolase-like protein  31.55 
 
 		 617 aa  42.4  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0433121  decreased coverage  0.00812081 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5408  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.3 
 
 		 634 aa  42.4  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.521256  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>