122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4386 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4386  endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 
269 aa  544  1e-154  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0990  endonuclease/exonuclease/phosphatase  64.96 
 
 
255 aa  328  7e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0962  endonuclease/exonuclease/phosphatase  64.96 
 
 
255 aa  328  8e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0980  endonuclease/exonuclease/phosphatase  64.96 
 
 
255 aa  328  8e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal  0.0626393 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0808  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  54.76 
 
 
257 aa  253  3e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.555445  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2832  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  51.56 
 
 
260 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.313269  decreased coverage  0.00271528 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2507  endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.89 
 
 
260 aa  181  8.000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.366976  normal  0.0314465 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3798  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.02 
 
 
263 aa  179  4.999999999999999e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00159012  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2356  endonuclease/exonuclease/phosphatase  48.3 
 
 
259 aa  176  5e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.400478  normal  0.0671284 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0929  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.31 
 
 
259 aa  150  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.391996  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0040  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.23 
 
 
329 aa  138  1e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1174  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.31 
 
 
257 aa  137  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.834262  normal  0.168848 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0330  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.85 
 
 
262 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0263555  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3480  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.26 
 
 
276 aa  109  4.0000000000000004e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1422  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.81 
 
 
235 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.329688 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3786  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.27 
 
 
269 aa  75.1  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11000  metal-dependent hydrolase  34.9 
 
 
316 aa  74.7  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0209  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.36 
 
 
283 aa  74.3  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2988  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.49 
 
 
282 aa  74.3  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.685317  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21370  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.49 
 
 
281 aa  72.8  0.000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1140  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.39 
 
 
231 aa  71.6  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2527  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.06 
 
 
576 aa  71.2  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4976  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.72 
 
 
266 aa  69.3  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000483065 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4845  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.79 
 
 
283 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346949  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5198  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.04 
 
 
278 aa  65.5  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.440175 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2528  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.25 
 
 
312 aa  65.1  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.772852  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0905  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.25 
 
 
278 aa  64.3  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965687  normal  0.246268 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3253  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28 
 
 
253 aa  63.9  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.378001  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0383  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.94 
 
 
266 aa  62.4  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4026  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.52 
 
 
265 aa  62  0.000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2702  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.1 
 
 
265 aa  60.5  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11820  metal-dependent hydrolase  38.24 
 
 
244 aa  59.3  0.00000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.502125  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6275  Metal-dependent hydrolase-like protein  28.31 
 
 
617 aa  59.3  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0433121  decreased coverage  0.00812081 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2799  endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.31 
 
 
244 aa  58.2  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4022  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.24 
 
 
271 aa  58.5  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5127  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.33 
 
 
242 aa  56.6  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.0539363 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0900  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.74 
 
 
257 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5423  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.68 
 
 
242 aa  56.2  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313531  hitchhiker  0.0062358 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3567  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.31 
 
 
286 aa  55.8  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.202667  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3513  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.75 
 
 
236 aa  55.8  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00703913  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0904  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.91 
 
 
289 aa  54.7  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  0.240953 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0607  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.97 
 
 
253 aa  54.7  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4697  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.9 
 
 
328 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0267  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.86 
 
 
291 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1524  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.32 
 
 
228 aa  53.5  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.9 
 
 
328 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.215897  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0791  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.54 
 
 
808 aa  53.9  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548418  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1343  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29 
 
 
279 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591358  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25550  metal-dependent hydrolase  29.32 
 
 
657 aa  53.1  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.202364 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0340  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  26.86 
 
 
291 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2363  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.46 
 
 
255 aa  52.8  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0051  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.34 
 
 
292 aa  52  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.171004 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2670  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.31 
 
 
260 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246537  normal  0.0515035 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5100  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.88 
 
 
284 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0779207 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4122  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.75 
 
 
287 aa  51.6  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24010  metal-dependent hydrolase  26.94 
 
 
286 aa  51.6  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.078651 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1188  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.91 
 
 
837 aa  51.6  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72430  hypothetical protein  27.69 
 
 
292 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6287  hypothetical protein  27.27 
 
 
274 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0420  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.39 
 
 
236 aa  50.8  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3363  hypothetical protein  35.23 
 
 
321 aa  50.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0719633 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5307  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.37 
 
 
244 aa  50.4  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2329  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.43 
 
 
248 aa  50.4  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000636938  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0003  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  26.94 
 
 
299 aa  50.1  0.00004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01980  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  27.27 
 
 
286 aa  50.1  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.496471  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3204  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.04 
 
 
259 aa  49.7  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0201  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.28 
 
 
264 aa  49.3  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3358  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.09 
 
 
298 aa  49.3  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2394  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  20.46 
 
 
243 aa  48.9  0.00008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3633  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.08 
 
 
252 aa  48.5  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0240015  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0997  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  25.57 
 
 
285 aa  48.1  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2520  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.06 
 
 
232 aa  48.5  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5493  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.95 
 
 
278 aa  48.1  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306278  hitchhiker  0.00234729 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0143  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.99 
 
 
284 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01462  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25 
 
 
233 aa  48.5  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2166  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.46 
 
 
286 aa  47.4  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2555  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.62 
 
 
257 aa  47.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.337597  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0694  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.89 
 
 
256 aa  47.4  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.4725  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0093  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.9 
 
 
294 aa  47.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2384  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.74 
 
 
300 aa  47.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1349  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.92 
 
 
287 aa  47.8  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.442404  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1842  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.19 
 
 
284 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.108875 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1327  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.09 
 
 
245 aa  46.2  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.51669  hitchhiker  0.00270426 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5450  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.82 
 
 
257 aa  46.2  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3406  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.16 
 
 
245 aa  46.2  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.325788  normal  0.617389 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2639  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.72 
 
 
288 aa  46.2  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0128  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.55 
 
 
284 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.503703  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3731  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24 
 
 
243 aa  45.8  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0145  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.55 
 
 
284 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.883526  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5005  hypothetical protein  26.28 
 
 
245 aa  45.8  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2759  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.84 
 
 
232 aa  45.8  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.429259  decreased coverage  0.00000225225 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2394  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.24 
 
 
240 aa  45.8  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0672115  normal  0.448912 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3505  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.75 
 
 
236 aa  45.8  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00443664 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1059  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  25 
 
 
285 aa  45.4  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0432754  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2228  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  29.65 
 
 
286 aa  45.4  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6261  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.23 
 
 
284 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1818  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.23 
 
 
284 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.543499  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0870  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.64 
 
 
287 aa  45.4  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.282627  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4197  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.64 
 
 
288 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5742  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.71 
 
 
233 aa  45.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0430039 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>