66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_11820 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_11820  metal-dependent hydrolase  100 
 
 		 244 aa  471  1e-132  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.502125  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1034  hypothetical protein  35 
 
 		 232 aa  98.6  7e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0980  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.32 
 
 		 249 aa  85.5  8e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0478352  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2759  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.93 
 
 		 232 aa  83.2  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.429259  decreased coverage  0.00000225225 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6062  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.88 
 
 		 236 aa  80.1  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.640142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2702  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 		 232 aa  76.3  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0273908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3046  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.65 
 
 		 235 aa  73.2  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000889267  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3505  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.79 
 
 		 236 aa  72.8  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443664 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32760  metal-dependent hydrolase  35.37 
 
 		 251 aa  72.8  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.244056  normal  0.481515 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1309  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.63 
 
 		 246 aa  71.6  0.000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.226265  normal  0.29104 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1140  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.45 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2702  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.79 
 
 		 265 aa  66.6  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3237  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.6 
 
 		 251 aa  65.9  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.207462  normal  0.0315354 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4976  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.59 
 
 		 266 aa  65.5  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000483065 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2205  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.84 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.586211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2988  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.17 
 
 		 282 aa  62.8  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.685317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4386  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.24 
 
 		 269 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01462  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.14 
 
 		 233 aa  58.2  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5005  hypothetical protein  33.11 
 
 		 245 aa  57.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21370  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.18 
 
 		 281 aa  55.5  0.0000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0209  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.05 
 
 		 283 aa  55.5  0.0000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5307  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.67 
 
 		 244 aa  55.5  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2670  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.47 
 
 		 260 aa  55.5  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246537  normal  0.0515035 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2849  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.56 
 
 		 644 aa  53.9  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00190481  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2799  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.5 
 
 		 244 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4026  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.57 
 
 		 265 aa  53.5  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0613  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.11 
 
 		 291 aa  53.1  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.97974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2865  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.62 
 
 		 261 aa  52.4  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2772  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.62 
 
 		 261 aa  52.4  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.472556  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0900  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.62 
 
 		 257 aa  52.4  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2679  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32 
 
 		 282 aa  52  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2329  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32 
 
 		 248 aa  51.2  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000636938  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0904  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.99 
 
 		 289 aa  50.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  0.240953 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1343  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.05 
 
 		 279 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591358  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3767  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.11 
 
 		 252 aa  50.1  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0769557 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0607  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.48 
 
 		 253 aa  49.7  0.00004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0383  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.21 
 
 		 266 aa  49.7  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2528  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.06 
 
 		 312 aa  49.3  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.772852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0870  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.03 
 
 		 287 aa  49.7  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.282627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3731  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.65 
 
 		 243 aa  48.9  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4045  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.89 
 
 		 242 aa  47.8  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3504  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  29.75 
 
 		 237 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.40759  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2520  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.89 
 
 		 232 aa  47.4  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3653  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.56 
 
 		 249 aa  46.6  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.477132  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5423  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.75 
 
 		 242 aa  47  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313531  hitchhiker  0.0062358 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2238  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.68 
 
 		 251 aa  46.2  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1193  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.2 
 
 		 244 aa  45.8  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0420  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.9 
 
 		 236 aa  45.4  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2642  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.62 
 
 		 289 aa  45.4  0.0009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.415202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0213  hypothetical protein  31.91 
 
 		 230 aa  44.7  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3119  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.45 
 
 		 271 aa  45.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.635423  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3554  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.53 
 
 		 319 aa  44.7  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0108  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  27.97 
 
 		 591 aa  44.7  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0093  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.69 
 
 		 294 aa  43.9  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2849  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 		 276 aa  43.9  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.942011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2877  hypothetical protein  28.57 
 
 		 277 aa  43.5  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0026  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.65 
 
 		 267 aa  42.7  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2363  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.97 
 
 		 255 aa  42.7  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0048  hypothetical protein  32.41 
 
 		 256 aa  42.4  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00965819  normal  0.1661 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2284  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.48 
 
 		 262 aa  42.4  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0656369  hitchhiker  0.000754964 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0201  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.8 
 
 		 264 aa  42.4  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2753  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.1 
 
 		 296 aa  42.7  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0702685  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4022  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.33 
 
 		 271 aa  42.4  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2601  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  30.41 
 
 		 282 aa  42.4  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.792599  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_118  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  28.23 
 
 		 639 aa  42  0.008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4845  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  38 
 
 		 283 aa  42  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346949  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>