105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1034 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1034  hypothetical protein  100 
 
 		 232 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3046  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  50.22 
 
 		 235 aa  181  6e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000889267  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2702  endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.44 
 
 		 232 aa  177  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0273908  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1309  endonuclease/exonuclease/phosphatase  46.35 
 
 		 246 aa  155  6e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.226265  normal  0.29104 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0980  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.69 
 
 		 249 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0478352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6062  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.83 
 
 		 236 aa  145  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.640142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3505  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40 
 
 		 236 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443664 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3237  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.45 
 
 		 251 aa  105  9e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.207462  normal  0.0315354 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2759  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.24 
 
 		 232 aa  94  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.429259  decreased coverage  0.00000225225 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11820  metal-dependent hydrolase  32.92 
 
 		 244 aa  92.4  5e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.502125  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32760  metal-dependent hydrolase  34.58 
 
 		 251 aa  78.2  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.244056  normal  0.481515 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5005  hypothetical protein  29.46 
 
 		 245 aa  75.9  0.0000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2205  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.4 
 
 		 260 aa  73.2  0.000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.586211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2702  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.46 
 
 		 265 aa  72.4  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2670  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.1 
 
 		 260 aa  72  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246537  normal  0.0515035 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0900  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.44 
 
 		 257 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5127  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.8 
 
 		 242 aa  71.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.0539363 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5423  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.61 
 
 		 242 aa  70.1  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313531  hitchhiker  0.0062358 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3513  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.02 
 
 		 236 aa  68.6  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00703913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4976  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.42 
 
 		 266 aa  68.6  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000483065 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2799  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.31 
 
 		 244 aa  67.8  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1514  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.96 
 
 		 246 aa  67  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.126297 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4697  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.98 
 
 		 328 aa  65.9  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.98 
 
 		 328 aa  65.5  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.215897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0905  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.63 
 
 		 278 aa  65.1  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965687  normal  0.246268 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2727  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.13 
 
 		 246 aa  65.1  0.0000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.216689  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4045  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.84 
 
 		 242 aa  64.7  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04435  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.17 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4845  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.9 
 
 		 283 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1343  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.08 
 
 		 279 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591358  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0692  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.83 
 
 		 245 aa  62  0.000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.221154  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0383  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.84 
 
 		 266 aa  61.6  0.000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0791  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.43 
 
 		 808 aa  60.8  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3406  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.85 
 
 		 245 aa  59.7  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.325788  normal  0.617389 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2988  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.9 
 
 		 282 aa  59.3  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.685317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0904  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.52 
 
 		 289 aa  58.9  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  0.240953 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2132  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.38 
 
 		 226 aa  57  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2601  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  31.75 
 
 		 282 aa  56.6  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.792599  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04291  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  27.65 
 
 		 319 aa  56.6  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.996404  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5411  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.05 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.746518 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1188  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.91 
 
 		 837 aa  55.8  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2325  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.4 
 
 		 231 aa  54.3  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.415298 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0821  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.28 
 
 		 281 aa  53.5  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0260  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.5 
 
 		 639 aa  52.8  0.000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.61014  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3253  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.7 
 
 		 253 aa  53.1  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.378001  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5450  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.09 
 
 		 257 aa  52  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24010  metal-dependent hydrolase  30.62 
 
 		 286 aa  52  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.078651 
 
 
-
 
NC_002936  DET0108  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  23.92 
 
 		 591 aa  51.6  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2872  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.48 
 
 		 621 aa  50.4  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_118  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  25.1 
 
 		 639 aa  50.8  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5198  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.48 
 
 		 278 aa  50.1  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.440175 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2166  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.99 
 
 		 286 aa  50.1  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0877  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.8 
 
 		 255 aa  49.7  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21370  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.68 
 
 		 281 aa  49.7  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0806  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.8 
 
 		 255 aa  49.7  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.636912  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0694  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.91 
 
 		 256 aa  49.3  0.00005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.4725  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0051  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.1 
 
 		 292 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.171004 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1156  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.98 
 
 		 370 aa  48.5  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.876276  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2639  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.98 
 
 		 288 aa  48.5  0.00009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2520  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.96 
 
 		 232 aa  47.8  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3653  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.91 
 
 		 249 aa  48.1  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.477132  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2528  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.78 
 
 		 312 aa  48.1  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.772852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1378  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.14 
 
 		 260 aa  48.1  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0914  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.27 
 
 		 335 aa  47  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4026  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.15 
 
 		 265 aa  47  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2679  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.78 
 
 		 282 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0159  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 		 290 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.171713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0781  hypothetical protein  33.07 
 
 		 256 aa  46.2  0.0004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2865  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.78 
 
 		 261 aa  46.2  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0858  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.24 
 
 		 371 aa  46.2  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0080  hypothetical protein  24.37 
 
 		 302 aa  45.8  0.0006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01980  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  36 
 
 		 286 aa  45.8  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.496471  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2329  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.06 
 
 		 248 aa  45.4  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000636938  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2772  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.4 
 
 		 261 aa  45.4  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.472556  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4120  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.85 
 
 		 250 aa  45.4  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5100  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.65 
 
 		 284 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0779207 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3760  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.91 
 
 		 249 aa  45.4  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0267  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.86 
 
 		 291 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72430  hypothetical protein  33.88 
 
 		 292 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6287  hypothetical protein  33.88 
 
 		 274 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3786  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.81 
 
 		 269 aa  44.7  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5307  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.82 
 
 		 244 aa  44.7  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0128  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 		 284 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.503703  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0340  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  33.86 
 
 		 291 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2393  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.1 
 
 		 277 aa  44.3  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0145  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 		 284 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.883526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0143  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 		 284 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2555  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.61 
 
 		 257 aa  43.9  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.337597  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1402  AP endonuclease domain-containing protein  24.35 
 
 		 310 aa  43.1  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.326174 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1299  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.95 
 
 		 252 aa  43.5  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1422  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.14 
 
 		 235 aa  43.1  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.329688 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3633  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.88 
 
 		 252 aa  43.5  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0240015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1140  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.31 
 
 		 231 aa  43.5  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4762  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.32 
 
 		 299 aa  43.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0469  hypothetical protein  32.14 
 
 		 248 aa  42.7  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.744864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3204  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.23 
 
 		 259 aa  43.1  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5493  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.45 
 
 		 278 aa  43.1  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306278  hitchhiker  0.00234729 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2849  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.33 
 
 		 276 aa  42.7  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.942011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3567  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.46 
 
 		 286 aa  42.4  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.202667  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0344  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.01 
 
 		 248 aa  42.4  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>