56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1378 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1378  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 
260 aa  526  1e-148  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0034  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  48.73 
 
 
280 aa  233  2.0000000000000002e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0129877 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2405  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.84 
 
 
280 aa  189  4e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.730344  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4762  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.89 
 
 
299 aa  184  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1018  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.67 
 
 
289 aa  183  3e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.746967  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0821  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.67 
 
 
281 aa  180  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3700  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.85 
 
 
298 aa  165  8e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0865051  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7169  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.8 
 
 
308 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000224117  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1565  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.29 
 
 
279 aa  161  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.647267  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2048  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.27 
 
 
274 aa  154  2e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.47219  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04291  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  35 
 
 
319 aa  142  6e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.996404  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2506  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.05 
 
 
256 aa  139  4.999999999999999e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1572  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.74 
 
 
284 aa  130  3e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.816455  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2292  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.15 
 
 
262 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0310197 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33238  conserved hypothetical protein  39.79 
 
 
388 aa  124  2e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0458  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.23 
 
 
303 aa  123  4e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.471158  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0522  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.64 
 
 
305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1311  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  26.85 
 
 
262 aa  116  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000133914  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30030  predicted protein  31.64 
 
 
320 aa  115  6.9999999999999995e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0364402  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0613  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.5 
 
 
291 aa  115  6.9999999999999995e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.97974  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1127  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  27.03 
 
 
262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0546014  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2176  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.19 
 
 
269 aa  111  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0693  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.14 
 
 
258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07298  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G16830)  32.42 
 
 
300 aa  106  4e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0568351  normal  0.0631032 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0817  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.04 
 
 
265 aa  102  7e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07690  metal-dependent hydrolase  38.07 
 
 
270 aa  102  9e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_49245  predicted protein  27.53 
 
 
318 aa  101  2e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1299  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.14 
 
 
271 aa  98.2  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06630  conserved hypothetical protein  36.07 
 
 
353 aa  96.7  3e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.109519  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1779  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.96 
 
 
261 aa  82.4  0.000000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2996  hypothetical protein  27.41 
 
 
302 aa  72.4  0.000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0791  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.08 
 
 
808 aa  65.9  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548418  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2948  metal-dependent hydrolase-like  29.47 
 
 
261 aa  65.1  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.599718  normal  0.516446 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1397  hypothetical protein  37.5 
 
 
160 aa  61.2  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1188  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.57 
 
 
837 aa  59.7  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4845  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.95 
 
 
283 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346949  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4976  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.66 
 
 
266 aa  55.8  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000483065 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0900  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.15 
 
 
257 aa  52.4  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.96 
 
 
328 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.215897  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2988  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.33 
 
 
282 aa  50.4  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.685317  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4697  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.34 
 
 
328 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2872  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.81 
 
 
621 aa  49.3  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5127  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.83 
 
 
242 aa  49.3  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.0539363 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5423  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.43 
 
 
242 aa  47  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313531  hitchhiker  0.0062358 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1958  hypothetical protein  33.33 
 
 
276 aa  46.6  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1034  hypothetical protein  27.92 
 
 
232 aa  46.2  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2528  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.09 
 
 
312 aa  45.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.772852  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2702  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.19 
 
 
265 aa  44.3  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3046  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.09 
 
 
235 aa  43.9  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000889267  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2727  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.31 
 
 
246 aa  43.9  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.216689  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0383  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.01 
 
 
266 aa  43.5  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6062  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.89 
 
 
236 aa  42.7  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.640142  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3501  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.95 
 
 
340 aa  42  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0181271  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1449  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.46 
 
 
364 aa  42  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0412722  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3786  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.74 
 
 
269 aa  42  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3776  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.18 
 
 
635 aa  42  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>