48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1565 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1565  endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 
279 aa  580  1.0000000000000001e-165  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.647267  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2405  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.35 
 
 
280 aa  248  6e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.730344  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4762  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.33 
 
 
299 aa  246  3e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0821  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.84 
 
 
281 aa  228  6e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2048  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.43 
 
 
274 aa  216  2.9999999999999998e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.47219  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1018  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.62 
 
 
289 aa  189  5.999999999999999e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.746967  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7169  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.08 
 
 
308 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000224117  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04291  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  33.94 
 
 
319 aa  163  2.0000000000000002e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.996404  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1378  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.29 
 
 
260 aa  151  1e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0693  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.95 
 
 
258 aa  144  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0034  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.88 
 
 
280 aa  140  3e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0129877 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1572  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.92 
 
 
284 aa  136  3.0000000000000003e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.816455  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2176  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.59 
 
 
269 aa  133  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3700  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.46 
 
 
298 aa  132  6e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0865051  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1299  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.04 
 
 
271 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0613  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.96 
 
 
291 aa  132  6.999999999999999e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.97974  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2292  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.5 
 
 
262 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0310197 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1311  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  33.71 
 
 
262 aa  122  6e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000133914  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1127  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  32.71 
 
 
262 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0546014  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2506  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.85 
 
 
256 aa  119  6e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33238  conserved hypothetical protein  35.12 
 
 
388 aa  118  9.999999999999999e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0817  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.76 
 
 
265 aa  115  7.999999999999999e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07690  metal-dependent hydrolase  30.74 
 
 
270 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30030  predicted protein  29.59 
 
 
320 aa  107  2e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0364402  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_49245  predicted protein  31.65 
 
 
318 aa  105  9e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0458  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.74 
 
 
303 aa  105  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.471158  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0522  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.18 
 
 
305 aa  103  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1779  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.2 
 
 
261 aa  102  6e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07298  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G16830)  28.57 
 
 
300 aa  92  9e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0568351  normal  0.0631032 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06630  conserved hypothetical protein  32.76 
 
 
353 aa  78.6  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.109519  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2872  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.71 
 
 
621 aa  72.4  0.000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3776  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.34 
 
 
635 aa  69.3  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2948  metal-dependent hydrolase-like  26.9 
 
 
261 aa  61.6  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.599718  normal  0.516446 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1397  hypothetical protein  40 
 
 
160 aa  61.2  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2996  hypothetical protein  20.66 
 
 
302 aa  52  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4845  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.12 
 
 
283 aa  49.3  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346949  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4697  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.12 
 
 
328 aa  47  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4283  Metal-dependent exonuclease protein  20.47 
 
 
286 aa  46.6  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21864  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1839  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.88 
 
 
571 aa  46.6  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.423161 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3873  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.95 
 
 
288 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0170416 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.27 
 
 
328 aa  45.4  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.215897  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43144  predicted protein  25.36 
 
 
409 aa  44.3  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.471661  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5127  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.91 
 
 
242 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.0539363 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2799  endonuclease/exonuclease/phosphatase  21.32 
 
 
244 aa  42.7  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0108  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  22.61 
 
 
591 aa  42.4  0.008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2988  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.14 
 
 
282 aa  42.4  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.685317  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2527  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.01 
 
 
576 aa  42.4  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5423  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.43 
 
 
242 aa  42  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313531  hitchhiker  0.0062358 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>