45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1127 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_1127  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  100 
 
 		 262 aa  531  1e-150  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0546014  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1311  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  98.09 
 
 		 262 aa  520  1e-146  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000133914  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3700  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.77 
 
 		 298 aa  151  8.999999999999999e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0865051  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2506  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.2 
 
 		 256 aa  136  3.0000000000000003e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1018  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.41 
 
 		 289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.746967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2048  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.09 
 
 		 274 aa  126  4.0000000000000003e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.47219  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04291  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  29.34 
 
 		 319 aa  125  7e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.996404  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1565  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.71 
 
 		 279 aa  124  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.647267  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2292  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.3 
 
 		 262 aa  122  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0310197 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0522  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.97 
 
 		 305 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0034  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.33 
 
 		 280 aa  120  3e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0129877 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1378  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27 
 
 		 260 aa  118  9e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4762  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.21 
 
 		 299 aa  118  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0693  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.08 
 
 		 258 aa  116  3.9999999999999997e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2176  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.68 
 
 		 269 aa  115  8.999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07690  metal-dependent hydrolase  29.77 
 
 		 270 aa  113  4.0000000000000004e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2405  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.23 
 
 		 280 aa  112  8.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.730344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7169  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.38 
 
 		 308 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000224117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0821  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.57 
 
 		 281 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0817  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.48 
 
 		 265 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0458  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.09 
 
 		 303 aa  108  8.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.471158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1572  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.17 
 
 		 284 aa  106  5e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.816455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1299  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.17 
 
 		 271 aa  103  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30030  predicted protein  29.81 
 
 		 320 aa  100  3e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0364402  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06630  conserved hypothetical protein  36.46 
 
 		 353 aa  99.4  6e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.109519  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0613  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.17 
 
 		 291 aa  97.8  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.97974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1779  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.13 
 
 		 261 aa  86.7  4e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33238  conserved hypothetical protein  27 
 
 		 388 aa  73.9  0.000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2996  hypothetical protein  21.01 
 
 		 302 aa  68.6  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_49245  predicted protein  26.43 
 
 		 318 aa  68.2  0.0000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1397  hypothetical protein  34.18 
 
 		 160 aa  56.6  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07298  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G16830)  25.99 
 
 		 300 aa  54.3  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0568351  normal  0.0631032 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2988  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.43 
 
 		 282 aa  50.8  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.685317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2528  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.44 
 
 		 312 aa  51.2  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.772852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2872  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.19 
 
 		 621 aa  50.1  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4976  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.43 
 
 		 266 aa  49.7  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000483065 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2948  metal-dependent hydrolase-like  24.71 
 
 		 261 aa  47.8  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.599718  normal  0.516446 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4928  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.99 
 
 		 375 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3776  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.42 
 
 		 635 aa  45.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2679  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.94 
 
 		 297 aa  44.3  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00635777  normal  0.660983 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0973  endonuclease/exonuclease/phosphatase  18.93 
 
 		 377 aa  43.5  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5198  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.63 
 
 		 278 aa  43.1  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.440175 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1007  endonuclease/exonuclease/phosphatase  19.57 
 
 		 377 aa  42.4  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.65557 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0969  endonuclease/exonuclease/phosphatase  19.57 
 
 		 377 aa  42.4  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2702  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.96 
 
 		 265 aa  42  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>