40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_7169 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_7169  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 		 308 aa  647    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000224117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4762  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.13 
 
 		 299 aa  239  4e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2405  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.5 
 
 		 280 aa  214  9.999999999999999e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.730344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0821  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.67 
 
 		 281 aa  201  9e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2048  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.02 
 
 		 274 aa  172  5.999999999999999e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.47219  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1565  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.08 
 
 		 279 aa  163  3e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.647267  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1018  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.82 
 
 		 289 aa  154  2e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.746967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1378  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.8 
 
 		 260 aa  151  1e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3700  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.13 
 
 		 298 aa  137  3.0000000000000003e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0865051  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0034  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.63 
 
 		 280 aa  129  5.0000000000000004e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0129877 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33238  conserved hypothetical protein  33.2 
 
 		 388 aa  124  2e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2506  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.39 
 
 		 256 aa  122  6e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2176  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.39 
 
 		 269 aa  122  6e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06630  conserved hypothetical protein  33.81 
 
 		 353 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.109519  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04291  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  28.03 
 
 		 319 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.996404  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1299  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.42 
 
 		 271 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30030  predicted protein  29.3 
 
 		 320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0364402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07690  metal-dependent hydrolase  29.96 
 
 		 270 aa  110  4.0000000000000004e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0817  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.13 
 
 		 265 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0613  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.89 
 
 		 291 aa  109  5e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.97974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0458  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.53 
 
 		 303 aa  108  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.471158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1572  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.04 
 
 		 284 aa  107  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.816455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0522  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.6 
 
 		 305 aa  106  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1311  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  28.57 
 
 		 262 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000133914  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2292  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.34 
 
 		 262 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0310197 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07298  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G16830)  28.57 
 
 		 300 aa  102  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0568351  normal  0.0631032 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1127  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  28.52 
 
 		 262 aa  100  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0546014  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0693  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.87 
 
 		 258 aa  92.4  9e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_49245  predicted protein  29.5 
 
 		 318 aa  87  3e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1779  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.32 
 
 		 261 aa  64.3  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2996  hypothetical protein  24.83 
 
 		 302 aa  58.9  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1397  hypothetical protein  36.49 
 
 		 160 aa  48.9  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3400  endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.87 
 
 		 378 aa  48.9  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2988  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.52 
 
 		 282 aa  47.8  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.685317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4845  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.91 
 
 		 283 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4697  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.33 
 
 		 328 aa  47  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2948  metal-dependent hydrolase-like  22.58 
 
 		 261 aa  47  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.599718  normal  0.516446 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1839  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.53 
 
 		 571 aa  46.2  0.0007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.423161 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.33 
 
 		 328 aa  46.2  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.215897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5423  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.97 
 
 		 242 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313531  hitchhiker  0.0062358 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>