32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_49245 on replicon NC_009047
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009047  PICST_49245  predicted protein  100 
 
 
318 aa  665    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33238  conserved hypothetical protein  38.06 
 
 
388 aa  195  1e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30030  predicted protein  35.57 
 
 
320 aa  156  4e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0364402  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07298  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G16830)  31.11 
 
 
300 aa  117  3e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0568351  normal  0.0631032 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0821  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.57 
 
 
281 aa  107  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1565  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.65 
 
 
279 aa  105  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.647267  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1018  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.92 
 
 
289 aa  94.4  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.746967  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1378  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.95 
 
 
260 aa  94.7  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06630  conserved hypothetical protein  28.91 
 
 
353 aa  92.4  8e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.109519  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1299  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.15 
 
 
271 aa  91.3  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7169  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.5 
 
 
308 aa  87  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000224117  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0034  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.78 
 
 
280 aa  85.1  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0129877 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4762  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.67 
 
 
299 aa  82.4  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2405  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.52 
 
 
280 aa  80.5  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.730344  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0458  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.2 
 
 
303 aa  78.6  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.471158  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2048  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.45 
 
 
274 aa  77  0.0000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.47219  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2176  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.62 
 
 
269 aa  74.3  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3700  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.31 
 
 
298 aa  67.8  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0865051  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1311  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  25.93 
 
 
262 aa  66.6  0.0000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000133914  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04291  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  23.41 
 
 
319 aa  63.2  0.000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.996404  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1127  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  25.46 
 
 
262 aa  63.2  0.000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0546014  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0522  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.73 
 
 
305 aa  60.8  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0817  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.5 
 
 
265 aa  60.5  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1572  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.53 
 
 
284 aa  58.5  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.816455  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07690  metal-dependent hydrolase  31.25 
 
 
270 aa  55.5  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2506  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.2 
 
 
256 aa  54.7  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2292  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.37 
 
 
262 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0310197 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0613  endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.83 
 
 
291 aa  47.8  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.97974  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0383  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.28 
 
 
266 aa  46.6  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0693  endonuclease/exonuclease/phosphatase  20.98 
 
 
258 aa  45.4  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2527  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.81 
 
 
576 aa  43.5  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2948  metal-dependent hydrolase-like  24.1 
 
 
261 aa  42.7  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.599718  normal  0.516446 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>