33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNC06630 on replicon NC_006685
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006685  CNC06630  conserved hypothetical protein  100 
 
 
353 aa  730    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.109519  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30030  predicted protein  36.73 
 
 
320 aa  126  5e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0364402  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7169  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.81 
 
 
308 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000224117  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0821  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.33 
 
 
281 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1018  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.32 
 
 
289 aa  116  5e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.746967  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33238  conserved hypothetical protein  36.17 
 
 
388 aa  112  1.0000000000000001e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4762  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.29 
 
 
299 aa  108  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07298  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G16830)  30.82 
 
 
300 aa  108  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0568351  normal  0.0631032 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2405  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.66 
 
 
280 aa  104  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.730344  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2048  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.65 
 
 
274 aa  95.9  8e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.47219  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_49245  predicted protein  28.91 
 
 
318 aa  92.8  8e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1378  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.52 
 
 
260 aa  91.7  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1311  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  36.31 
 
 
262 aa  88.6  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000133914  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1127  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  36.46 
 
 
262 aa  86.7  6e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0546014  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3700  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 
298 aa  84.3  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0865051  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07690  metal-dependent hydrolase  35.29 
 
 
270 aa  84  0.000000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2176  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.48 
 
 
269 aa  81.6  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04291  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  31.09 
 
 
319 aa  80.5  0.00000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.996404  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0034  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.33 
 
 
280 aa  80.1  0.00000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0129877 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1572  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.71 
 
 
284 aa  78.6  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.816455  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1565  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.57 
 
 
279 aa  78.6  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.647267  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2506  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.93 
 
 
256 aa  77  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0458  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.91 
 
 
303 aa  75.5  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.471158  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1299  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.67 
 
 
271 aa  74.7  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0522  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.57 
 
 
305 aa  70.9  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0693  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.07 
 
 
258 aa  63.9  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2292  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.4 
 
 
262 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0310197 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0613  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.65 
 
 
291 aa  58.5  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.97974  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0817  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.79 
 
 
265 aa  55.8  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0760  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.23 
 
 
379 aa  49.3  0.00009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1779  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28 
 
 
261 aa  48.5  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2948  metal-dependent hydrolase-like  22.67 
 
 
261 aa  45.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.599718  normal  0.516446 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1397  hypothetical protein  37.84 
 
 
160 aa  43.9  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>