45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0034 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0034  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 		 280 aa  554  1e-157  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0129877 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1378  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  48 
 
 		 260 aa  222  6e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0821  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.1 
 
 		 281 aa  163  3e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2405  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.81 
 
 		 280 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.730344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4762  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 		 299 aa  152  7e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1018  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.07 
 
 		 289 aa  151  1e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.746967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1565  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.88 
 
 		 279 aa  140  3e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.647267  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3700  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.64 
 
 		 298 aa  138  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0865051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7169  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.63 
 
 		 308 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000224117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1311  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  27.05 
 
 		 262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000133914  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0817  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.39 
 
 		 265 aa  116  5e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04291  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  33.81 
 
 		 319 aa  115  8.999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.996404  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2048  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.54 
 
 		 274 aa  115  8.999999999999998e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.47219  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1127  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  26.33 
 
 		 262 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0546014  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0693  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.64 
 
 		 258 aa  113  4.0000000000000004e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2506  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.5 
 
 		 256 aa  110  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2176  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.79 
 
 		 269 aa  109  6e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0613  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.93 
 
 		 291 aa  106  4e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.97974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2292  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.47 
 
 		 262 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0310197 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0522  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.89 
 
 		 305 aa  101  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1572  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.39 
 
 		 284 aa  100  4e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.816455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1299  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.14 
 
 		 271 aa  98.2  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33238  conserved hypothetical protein  28.46 
 
 		 388 aa  96.7  3e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30030  predicted protein  27.7 
 
 		 320 aa  97.1  3e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0364402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0458  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.87 
 
 		 303 aa  91.3  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.471158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07690  metal-dependent hydrolase  37.04 
 
 		 270 aa  86.7  4e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1779  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.52 
 
 		 261 aa  86.7  4e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_49245  predicted protein  23.78 
 
 		 318 aa  85.1  0.000000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06630  conserved hypothetical protein  31.76 
 
 		 353 aa  77.4  0.0000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.109519  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07298  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G16830)  27.04 
 
 		 300 aa  74.7  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0568351  normal  0.0631032 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2996  hypothetical protein  29.15 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2948  metal-dependent hydrolase-like  26.04 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.599718  normal  0.516446 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1397  hypothetical protein  43.04 
 
 		 160 aa  63.9  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0791  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.55 
 
 		 808 aa  58.5  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548418  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1349  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.35 
 
 		 287 aa  54.3  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.442404  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5423  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30 
 
 		 242 aa  50.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313531  hitchhiker  0.0062358 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4122  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.59 
 
 		 287 aa  49.7  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4697  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.93 
 
 		 328 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3653  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.05 
 
 		 249 aa  48.5  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.477132  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0383  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.79 
 
 		 266 aa  48.1  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.34 
 
 		 328 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.215897  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3760  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.71 
 
 		 249 aa  46.2  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4024  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.21 
 
 		 278 aa  45.8  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.284823  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5127  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.12 
 
 		 242 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.0539363 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4845  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.03 
 
 		 283 aa  44.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346949  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>