41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1018 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_1018  endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 
289 aa  587  1e-167  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.746967  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0821  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.21 
 
 
281 aa  206  4e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2405  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.54 
 
 
280 aa  196  3e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.730344  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1565  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.59 
 
 
279 aa  192  4e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.647267  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4762  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.93 
 
 
299 aa  186  5e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2048  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.87 
 
 
274 aa  184  2.0000000000000003e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.47219  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1378  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.67 
 
 
260 aa  178  9e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7169  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.48 
 
 
308 aa  157  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000224117  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0034  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.07 
 
 
280 aa  151  1e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0129877 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3700  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.66 
 
 
298 aa  139  6e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0865051  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30030  predicted protein  33.85 
 
 
320 aa  135  5e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0364402  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2176  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.81 
 
 
269 aa  135  6.0000000000000005e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1311  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  28.85 
 
 
262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000133914  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04291  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  34.88 
 
 
319 aa  128  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.996404  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1127  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  28.41 
 
 
262 aa  126  5e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0546014  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1299  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.26 
 
 
271 aa  124  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0613  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.58 
 
 
291 aa  121  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.97974  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33238  conserved hypothetical protein  33.2 
 
 
388 aa  120  3.9999999999999996e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06630  conserved hypothetical protein  38.5 
 
 
353 aa  116  3e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.109519  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0522  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.15 
 
 
305 aa  115  6.9999999999999995e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0817  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 
265 aa  115  8.999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0458  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.63 
 
 
303 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.471158  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2506  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.06 
 
 
256 aa  110  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0693  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.68 
 
 
258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2292  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.39 
 
 
262 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0310197 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07298  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G16830)  33.07 
 
 
300 aa  107  3e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0568351  normal  0.0631032 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_49245  predicted protein  26.92 
 
 
318 aa  94.7  2e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1779  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.62 
 
 
261 aa  91.3  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07690  metal-dependent hydrolase  32.09 
 
 
270 aa  87.8  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1572  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.24 
 
 
284 aa  86.3  6e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.816455  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2948  metal-dependent hydrolase-like  28.79 
 
 
261 aa  78.6  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.599718  normal  0.516446 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2996  hypothetical protein  26.18 
 
 
302 aa  73.2  0.000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2872  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.62 
 
 
621 aa  59.3  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3776  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.47 
 
 
635 aa  53.9  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0791  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.64 
 
 
808 aa  50.4  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548418  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4845  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.47 
 
 
283 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346949  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4697  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.47 
 
 
328 aa  49.3  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5423  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.26 
 
 
242 aa  43.1  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313531  hitchhiker  0.0062358 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26071  predicted protein  21.43 
 
 
578 aa  42.7  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.465211 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2988  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.58 
 
 
282 aa  42.7  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.685317  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2418  exodeoxyribonuclease III  28.28 
 
 
277 aa  42.4  0.01  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>