30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0760 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0760  endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 		 379 aa  780    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3245  endonuclease/exonuclease/phosphatase  55.71 
 
 		 377 aa  419  1e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0973  endonuclease/exonuclease/phosphatase  51.05 
 
 		 377 aa  375  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1007  endonuclease/exonuclease/phosphatase  50.52 
 
 		 377 aa  373  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.65557 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0969  endonuclease/exonuclease/phosphatase  50.79 
 
 		 377 aa  371  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3519  endonuclease/exonuclease/phosphatase  48.6 
 
 		 398 aa  364  1e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.546474  normal  0.80442 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3394  endonuclease/exonuclease/phosphatase  46.9 
 
 		 402 aa  362  6e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3298  endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.24 
 
 		 403 aa  360  2e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1148  hypothetical protein  50.26 
 
 		 377 aa  359  4e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2933  endonuclease/exonuclease/phosphatase  48.21 
 
 		 396 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1059  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  46.65 
 
 		 408 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000904617 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0801  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.16 
 
 		 355 aa  318  7e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.940089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0818  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.32 
 
 		 379 aa  317  3e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.823594  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3781  hypothetical protein  44.3 
 
 		 381 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1308  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  40.41 
 
 		 410 aa  296  6e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1020  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.58 
 
 		 358 aa  286  4e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0690  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.48 
 
 		 357 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0327295  normal  0.622853 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2966  hypothetical protein  39.08 
 
 		 394 aa  276  5e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1331  hypothetical protein  38.46 
 
 		 338 aa  243  3.9999999999999997e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05956  hypothetical protein  36.29 
 
 		 317 aa  229  5e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000220  hypothetical protein  36.41 
 
 		 317 aa  228  1e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5372  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.14 
 
 		 352 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.18295 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3683  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.49 
 
 		 346 aa  91.7  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1653  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.27 
 
 		 341 aa  87  5e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1043  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.17 
 
 		 341 aa  82  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000546658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1330  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  27 
 
 		 341 aa  80.9  0.00000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000015519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3785  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.94 
 
 		 333 aa  80.9  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1438  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.27 
 
 		 374 aa  56.6  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5248  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23 
 
 		 353 aa  54.7  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.284119  normal  0.61528 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06630  conserved hypothetical protein  27.23 
 
 		 353 aa  49.3  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.109519  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>