29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05956 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05956  hypothetical protein  100 
 
 		 317 aa  663    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000220  hypothetical protein  70.03 
 
 		 317 aa  466  9.999999999999999e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3781  hypothetical protein  41.98 
 
 		 381 aa  251  8.000000000000001e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0801  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.35 
 
 		 355 aa  246  4e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.940089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1331  hypothetical protein  41.87 
 
 		 338 aa  240  2e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0690  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.49 
 
 		 357 aa  232  5e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0327295  normal  0.622853 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1148  hypothetical protein  38.02 
 
 		 377 aa  229  4e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0760  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.29 
 
 		 379 aa  229  4e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1007  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.36 
 
 		 377 aa  224  2e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.65557 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0818  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.46 
 
 		 379 aa  223  3e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.823594  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0973  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.36 
 
 		 377 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0969  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.09 
 
 		 377 aa  222  7e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2933  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.53 
 
 		 396 aa  217  2e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3298  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.27 
 
 		 403 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3519  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.49 
 
 		 398 aa  216  4e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.546474  normal  0.80442 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1059  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.79 
 
 		 408 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000904617 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1020  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.1 
 
 		 358 aa  209  4e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3394  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.23 
 
 		 402 aa  209  4e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3245  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.99 
 
 		 377 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1308  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  33.88 
 
 		 410 aa  191  1e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2966  hypothetical protein  33.06 
 
 		 394 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3683  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.55 
 
 		 346 aa  99.4  7e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3785  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.19 
 
 		 333 aa  90.1  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5248  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.04 
 
 		 353 aa  81.6  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.284119  normal  0.61528 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1330  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  25.47 
 
 		 341 aa  79.7  0.00000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000015519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1653  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.04 
 
 		 341 aa  79.3  0.00000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1043  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.16 
 
 		 341 aa  79  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000546658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1438  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.52 
 
 		 374 aa  73.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5372  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25 
 
 		 352 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.18295 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>