28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_3519 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_3519  endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 
398 aa  822    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.546474  normal  0.80442 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1059  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  94.61 
 
 
408 aa  789    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000904617 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3394  endonuclease/exonuclease/phosphatase  91.04 
 
 
402 aa  745    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2933  endonuclease/exonuclease/phosphatase  91.07 
 
 
396 aa  746    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3298  endonuclease/exonuclease/phosphatase  96.28 
 
 
403 aa  794    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0969  endonuclease/exonuclease/phosphatase  74.74 
 
 
377 aa  587  1e-167  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1007  endonuclease/exonuclease/phosphatase  74.47 
 
 
377 aa  587  1e-167  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.65557 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0973  endonuclease/exonuclease/phosphatase  74.74 
 
 
377 aa  590  1e-167  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1148  hypothetical protein  75.14 
 
 
377 aa  578  1e-164  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3245  endonuclease/exonuclease/phosphatase  46.97 
 
 
377 aa  373  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0760  endonuclease/exonuclease/phosphatase  48.6 
 
 
379 aa  364  2e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0818  endonuclease/exonuclease/phosphatase  48.68 
 
 
379 aa  348  7e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.823594  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0801  endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.51 
 
 
355 aa  346  3e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.940089  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3781  hypothetical protein  47.97 
 
 
381 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1020  endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.89 
 
 
358 aa  331  1e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1308  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  44.39 
 
 
410 aa  331  1e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2966  hypothetical protein  42.18 
 
 
394 aa  310  2e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0690  endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.39 
 
 
357 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0327295  normal  0.622853 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1331  hypothetical protein  39.68 
 
 
338 aa  264  2e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000220  hypothetical protein  37.4 
 
 
317 aa  228  2e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05956  hypothetical protein  36.49 
 
 
317 aa  216  5e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3785  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.33 
 
 
333 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3683  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.39 
 
 
346 aa  84  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5248  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.05 
 
 
353 aa  81.3  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.284119  normal  0.61528 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5372  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.99 
 
 
352 aa  70.5  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.18295 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1043  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.14 
 
 
341 aa  64.7  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000546658  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1330  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  25.5 
 
 
341 aa  63.5  0.000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000015519  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1653  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.6 
 
 
341 aa  57.4  0.0000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>