33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_5372 on replicon NC_011880
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011880  Cyan7425_5372  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 
352 aa  717    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.18295 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3785  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.55 
 
 
333 aa  205  8e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3683  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.32 
 
 
346 aa  145  7.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1653  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.69 
 
 
341 aa  143  4e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1043  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.21 
 
 
341 aa  135  9.999999999999999e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000546658  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1330  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  30.82 
 
 
341 aa  133  5e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000015519  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5248  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.49 
 
 
353 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.284119  normal  0.61528 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1438  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.11 
 
 
374 aa  103  6e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0760  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.14 
 
 
379 aa  95.1  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0690  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.73 
 
 
357 aa  92.8  7e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0327295  normal  0.622853 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0801  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.68 
 
 
355 aa  89.7  6e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.940089  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3781  hypothetical protein  25.6 
 
 
381 aa  89.4  8e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1020  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.42 
 
 
358 aa  89.4  8e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2966  hypothetical protein  25.07 
 
 
394 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0818  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.55 
 
 
379 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.823594  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3704  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.75 
 
 
322 aa  81.3  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1148  hypothetical protein  24.16 
 
 
377 aa  79  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1308  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  23.65 
 
 
410 aa  75.9  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0969  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.23 
 
 
377 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1007  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.09 
 
 
377 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.65557 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0973  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.16 
 
 
377 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3519  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.99 
 
 
398 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.546474  normal  0.80442 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1331  hypothetical protein  24.42 
 
 
338 aa  69.3  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1059  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.14 
 
 
408 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000904617 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3245  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.38 
 
 
377 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05956  hypothetical protein  25 
 
 
317 aa  65.1  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3298  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.44 
 
 
403 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000220  hypothetical protein  25.07 
 
 
317 aa  64.3  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3394  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.06 
 
 
402 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2933  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.19 
 
 
396 aa  59.7  0.00000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1518  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.05 
 
 
336 aa  58.2  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000454364  hitchhiker  0.00000000880332 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0711  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.24 
 
 
334 aa  47.4  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1247  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.9 
 
 
437 aa  44.3  0.003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>