73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0711 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0711  endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 
334 aa  675    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1027  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.64 
 
 
347 aa  227  2e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0904827  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1506  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.39 
 
 
310 aa  178  1e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0135963  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0041  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.1 
 
 
460 aa  131  1.0000000000000001e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.294388  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0006  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.71 
 
 
499 aa  118  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113565  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1247  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.68 
 
 
437 aa  118  1.9999999999999998e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1372  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.34 
 
 
480 aa  108  1e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0824  endonuclease/exonuclease/phosphatase, putative  29.97 
 
 
431 aa  108  2e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0502024  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1021  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25 
 
 
342 aa  95.1  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0605  hypothetical protein  28.82 
 
 
413 aa  93.2  5e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.662935 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02630  hypothetical protein  27.41 
 
 
359 aa  91.3  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.249483  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1377  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.55 
 
 
325 aa  90.9  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1102  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.32 
 
 
341 aa  89  9e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1180  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.14 
 
 
347 aa  87  4e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.494829  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1196  hypothetical protein  27.52 
 
 
348 aa  85.9  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04510  hypothetical protein  24.78 
 
 
324 aa  79.7  0.00000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1431  hypothetical protein  23.12 
 
 
331 aa  75.9  0.0000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1220  hypothetical protein  23.28 
 
 
363 aa  72  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.133242  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3704  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  21.05 
 
 
322 aa  70.9  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0946  hypothetical protein  23.81 
 
 
342 aa  68.6  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1186  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.51 
 
 
342 aa  65.9  0.0000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.402884  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2587  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  24.4 
 
 
339 aa  65.1  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.140684  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1119  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.51 
 
 
348 aa  64.3  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6766  endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.29 
 
 
326 aa  62.8  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1518  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.2 
 
 
307 aa  62.8  0.000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.010093  normal  0.0422931 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2783  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.78 
 
 
313 aa  62.4  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0990816  normal  0.632411 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5836  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.98 
 
 
592 aa  60.8  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1169  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.65 
 
 
343 aa  58.2  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2988  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.35 
 
 
282 aa  55.8  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.685317  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2642  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.28 
 
 
289 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.415202  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4120  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.36 
 
 
250 aa  53.9  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.93 
 
 
263 aa  53.5  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42531  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6501  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.93 
 
 
263 aa  53.5  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.126817  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6314  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.93 
 
 
269 aa  52.8  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0901897 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4022  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.1 
 
 
271 aa  52.4  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5343  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.74 
 
 
940 aa  52  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.799398 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0398  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.76 
 
 
1073 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6090  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25 
 
 
258 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18128  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5588  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.93 
 
 
269 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15644  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1327  endonuclease/exonuclease/phosphatase  21.99 
 
 
245 aa  52.4  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.51669  hitchhiker  0.00270426 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1104  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.62 
 
 
601 aa  50.8  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.604194 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3633  endonuclease/exonuclease/phosphatase  21.78 
 
 
252 aa  50.4  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0240015  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5493  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.4 
 
 
278 aa  49.3  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306278  hitchhiker  0.00234729 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1524  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.53 
 
 
228 aa  48.9  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2528  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.87 
 
 
312 aa  48.9  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.772852  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5450  endonuclease/exonuclease/phosphatase  21.35 
 
 
257 aa  47.8  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5372  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.24 
 
 
352 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.18295 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2384  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.61 
 
 
300 aa  47.8  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0806  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.22 
 
 
255 aa  47  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.636912  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3786  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.4 
 
 
269 aa  47  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0085  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25 
 
 
598 aa  47  0.0005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1073  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.24 
 
 
597 aa  47  0.0005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0877  endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.22 
 
 
255 aa  47  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00081  nuclease  24.61 
 
 
982 aa  46.6  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1677  exodeoxyribonuclease III Xth  24.14 
 
 
263 aa  45.8  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1473  hypothetical protein  22.37 
 
 
273 aa  46.2  0.0009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.257293  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0195  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.28 
 
 
821 aa  45.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.937646  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2121  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.17 
 
 
382 aa  45.8  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6162  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.51 
 
 
252 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0634319  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0209  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.19 
 
 
283 aa  45.1  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0829  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.86 
 
 
790 aa  45.1  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.889432  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2679  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  20.53 
 
 
297 aa  44.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00635777  normal  0.660983 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0990  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.71 
 
 
788 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.442122  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1000  hypothetical protein  24.51 
 
 
1076 aa  44.3  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5742  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.65 
 
 
233 aa  43.9  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0430039 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1003  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  23.2 
 
 
788 aa  43.9  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487379  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5198  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  21.17 
 
 
278 aa  43.9  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.440175 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1156  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  23.2 
 
 
788 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1075  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  23.2 
 
 
583 aa  43.9  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002273  predicted extracellular nuclease  23.83 
 
 
984 aa  43.5  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21370  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.75 
 
 
281 aa  43.5  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1234  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  23.71 
 
 
788 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1171  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  23.4 
 
 
788 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>