26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2121 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2121  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 		 382 aa  773    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3228  endonuclease/exonuclease/phosphatase  50.77 
 
 		 385 aa  341  1e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.139058 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0989  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.77 
 
 		 375 aa  281  2e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.951978 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5499  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.77 
 
 		 399 aa  227  3e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.749951  normal  0.0277313 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0232  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.2 
 
 		 381 aa  142  9e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0236  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.24 
 
 		 381 aa  127  3e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3854  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.49 
 
 		 380 aa  126  7e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.676972  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1934  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.9 
 
 		 368 aa  75.5  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1364  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.75 
 
 		 345 aa  74.3  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2847  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.72 
 
 		 296 aa  73.9  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.453576  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2753  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.72 
 
 		 296 aa  74.3  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0702685  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1377  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.91 
 
 		 325 aa  69.7  0.00000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2720  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.62 
 
 		 375 aa  64.7  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.389489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2662  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.34 
 
 		 300 aa  63.9  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.273775  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1817  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.29 
 
 		 369 aa  58.2  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2732  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.04 
 
 		 369 aa  57.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.178796  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02630  hypothetical protein  26.54 
 
 		 359 aa  57  0.0000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.249483  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1498  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.24 
 
 		 370 aa  55.5  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0930511  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0711  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.5 
 
 		 334 aa  52  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2642  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.13 
 
 		 289 aa  50.1  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.415202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2478  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.94 
 
 		 369 aa  47  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.902577 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0247  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.03 
 
 		 338 aa  47  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1859  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.05 
 
 		 344 aa  47  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6766  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.1 
 
 		 326 aa  46.2  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1220  hypothetical protein  25.21 
 
 		 363 aa  46.2  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.133242  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1180  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.03 
 
 		 347 aa  44.7  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.494829  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>