25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0989 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_0989  endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 
375 aa  772    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.951978 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3228  endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.56 
 
 
385 aa  299  5e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.139058 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2121  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.51 
 
 
382 aa  272  5.000000000000001e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5499  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.48 
 
 
399 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.749951  normal  0.0277313 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0232  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.41 
 
 
381 aa  173  5e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3854  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.67 
 
 
380 aa  167  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.676972  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0236  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.9 
 
 
381 aa  164  3e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1364  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.69 
 
 
345 aa  99.8  7e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2753  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.1 
 
 
296 aa  77.4  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0702685  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2847  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.1 
 
 
296 aa  76.3  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.453576  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2720  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.95 
 
 
375 aa  72  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.389489  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2662  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.59 
 
 
300 aa  64.7  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.273775  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1934  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.56 
 
 
368 aa  64.3  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02630  hypothetical protein  31.18 
 
 
359 aa  57.8  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.249483  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1498  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.95 
 
 
370 aa  54.7  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0930511  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2642  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.85 
 
 
289 aa  53.9  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.415202  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1817  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.92 
 
 
369 aa  50.8  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04510  hypothetical protein  25.68 
 
 
324 aa  48.1  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1220  hypothetical protein  24.48 
 
 
363 aa  47.8  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.133242  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1102  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.26 
 
 
341 aa  46.2  0.0009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2732  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.94 
 
 
369 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.178796  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1186  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.77 
 
 
342 aa  43.9  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.402884  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0605  hypothetical protein  28.99 
 
 
413 aa  43.9  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.662935 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1377  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.43 
 
 
325 aa  43.5  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1021  endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.57 
 
 
342 aa  43.5  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>