18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1934 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1934  endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 		 368 aa  761    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2732  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  73.64 
 
 		 369 aa  547  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.178796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2478  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  75.27 
 
 		 369 aa  545  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.902577 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1498  endonuclease/exonuclease/phosphatase  61.25 
 
 		 370 aa  481  1e-135  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0930511  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1817  endonuclease/exonuclease/phosphatase  63.01 
 
 		 369 aa  483  1e-135  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2720  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.97 
 
 		 375 aa  215  9.999999999999999e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.389489  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3854  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.06 
 
 		 380 aa  78.2  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.676972  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2121  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.58 
 
 		 382 aa  71.6  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5499  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.37 
 
 		 399 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.749951  normal  0.0277313 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0236  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.17 
 
 		 381 aa  67  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0232  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.17 
 
 		 381 aa  65.5  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0989  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.56 
 
 		 375 aa  64.3  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.951978 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1364  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.43 
 
 		 345 aa  61.2  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3228  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.39 
 
 		 385 aa  60.5  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.139058 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2753  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.73 
 
 		 296 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0702685  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2642  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.95 
 
 		 289 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.415202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2847  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.73 
 
 		 296 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.453576  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2662  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.51 
 
 		 300 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.273775  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>