18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2720 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2720  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 		 375 aa  771    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.389489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1934  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.97 
 
 		 368 aa  215  9.999999999999999e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1498  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.82 
 
 		 370 aa  208  1e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0930511  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1817  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.02 
 
 		 369 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2732  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.78 
 
 		 369 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.178796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2478  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.28 
 
 		 369 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.902577 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1364  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.02 
 
 		 345 aa  90.9  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0989  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.95 
 
 		 375 aa  72  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.951978 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3854  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.13 
 
 		 380 aa  68.6  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.676972  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0232  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.05 
 
 		 381 aa  66.6  0.0000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0236  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.14 
 
 		 381 aa  64.3  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5499  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.76 
 
 		 399 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.749951  normal  0.0277313 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2753  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.92 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0702685  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2121  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.38 
 
 		 382 aa  57.8  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2847  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.79 
 
 		 296 aa  57  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.453576  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2783  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.03 
 
 		 313 aa  55.1  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0990816  normal  0.632411 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3228  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.85 
 
 		 385 aa  51.2  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.139058 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0958  exodeoxyribonuclease III Xth  27.34 
 
 		 253 aa  43.9  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>