22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3228 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3228  endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 		 385 aa  781    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.139058 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2121  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  50.77 
 
 		 382 aa  331  1e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0989  endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.56 
 
 		 375 aa  299  5e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.951978 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5499  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.42 
 
 		 399 aa  218  2e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.749951  normal  0.0277313 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0232  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.37 
 
 		 381 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0236  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.27 
 
 		 381 aa  145  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3854  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.95 
 
 		 380 aa  143  4e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.676972  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1364  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.92 
 
 		 345 aa  83.2  0.000000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2753  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.8 
 
 		 296 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0702685  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2847  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.88 
 
 		 296 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.453576  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1377  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.97 
 
 		 325 aa  61.6  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2662  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.53 
 
 		 300 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.273775  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1934  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.39 
 
 		 368 aa  60.5  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2642  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.73 
 
 		 289 aa  57.4  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.415202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2720  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.85 
 
 		 375 aa  51.2  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.389489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1169  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.57 
 
 		 343 aa  48.1  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1506  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.84 
 
 		 310 aa  47.4  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0135963  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1021  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.22 
 
 		 342 aa  47  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1817  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.57 
 
 		 369 aa  46.6  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1498  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.01 
 
 		 370 aa  43.9  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0930511  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1102  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.33 
 
 		 341 aa  43.5  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2732  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.76 
 
 		 369 aa  43.5  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.178796  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>