25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0232 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0236  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  94.75 
 
 		 381 aa  723    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0232  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 		 381 aa  788    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3854  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  71.39 
 
 		 380 aa  584  1.0000000000000001e-165  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.676972  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0989  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.41 
 
 		 375 aa  173  5e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.951978 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3228  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.37 
 
 		 385 aa  146  6e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.139058 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5499  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.9 
 
 		 399 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.749951  normal  0.0277313 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2121  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.96 
 
 		 382 aa  128  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1364  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.1 
 
 		 345 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1498  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.55 
 
 		 370 aa  68.6  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0930511  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2720  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.05 
 
 		 375 aa  66.6  0.0000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.389489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1934  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.17 
 
 		 368 aa  65.5  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2732  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.57 
 
 		 369 aa  57.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.178796  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02630  hypothetical protein  26.92 
 
 		 359 aa  53.5  0.000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.249483  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2753  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.49 
 
 		 296 aa  53.1  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0702685  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04510  hypothetical protein  32.67 
 
 		 324 aa  52.8  0.000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2847  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.49 
 
 		 296 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.453576  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01224  extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein  25.38 
 
 		 1346 aa  52  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1817  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.4 
 
 		 369 aa  50.8  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2478  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.57 
 
 		 369 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.902577 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2642  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.46 
 
 		 289 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.415202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1119  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.92 
 
 		 348 aa  48.1  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0398  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.17 
 
 		 1073 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1102  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.7 
 
 		 341 aa  44.7  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1063  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.35 
 
 		 554 aa  43.9  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1506  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.35 
 
 		 310 aa  43.5  0.007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0135963  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>